综述:超越自然时钟:通过超突变加速基因组多样性

【字体: 时间:2025年07月07日 来源:Biotechnology Advances 12.1

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  这篇综述系统探讨了超突变技术(hypermutation)在突破自然突变率限制方面的前沿进展,涵盖靶向(targeted)、多靶点(multi-target)和全基因组(genome-wide)策略,及其在合成生物学、进化研究和工业应用中的变革潜力。通过对比突变范围(scope)、速率(10?12–10?8/bp/代)和类型(SNP/SV/CNV),为遗传多样性挖掘提供了工具选择指南,并展望了高通量筛选和AI预测模型等未来方向。

  

Abstract

基因突变是遗传变异的根本来源,但自然突变率(10?12–10?8/bp/代)难以满足生物技术需求。超突变技术通过靶向、多靶点或全基因组策略加速突变积累,突破自然限制。这些工具在突变范围(局部到全基因组)、速率(如CRISPR介导的定向进化)和类型(SNP/SV/CNV)上各具优势,为合成生物学和工业应用解锁了前所未有的遗传景观。

Introduction

自然突变源于复制错误或DNA损伤,表现为单核苷酸多态性(SNP)、结构变异(SV)和染色体数目变异(CNV)。SNP虽微小(如人类基因组1/1000 bp),却可影响抗生素抗性或表型多样性;SV(>50 bp)通过改变基因剂量或调控元件驱动适应性进化;CNV(如多倍体)在植物中促进环境适应。然而,自然突变率受进化最小化约束,难以满足人工需求。

Targeted hypermutation

传统方法如易错PCR需体外操作且效率低。新型CRISPR-Cas9衍生物(如碱基编辑器)或正交DNA复制系统(orthogonal replication)实现了活细胞内的精准靶向突变,适用于酶定向进化或疾病模型构建。

Hypermutation derived application revolution

超突变技术已应用于作物抗逆性改良(如多倍体诱导)、微生物工厂优化(如抗生素高产菌株)、癌症模型构建(通过CNV模拟染色体不稳定性)等领域,显著加速了表型筛选和功能基因组学研究。

Concluding remarks

未来需开发高通量筛选平台和AI驱动的突变预测模型,以解决现有技术的脱靶效应和表型预测瓶颈。超突变技术正成为连接自然进化与工程生物学的桥梁,为探索“不可进化”的遗传空间提供钥匙。

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