PRIMED联盟数据共享机制:优化多基因风险预测的跨源异构数据整合策略

【字体: 时间:2025年07月08日 来源:AJHG 9.8

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  【编辑推荐】美国NIH资助的PRIMED联盟针对多基因风险评分(PRS)在多样化人群中的应用瓶颈,创新性设计协调式dbGaP申请和联盟数据共享协议(CDSA)双机制,通过NHGRI AnVIL云平台实现受限数据的联邦分析与衍生数据共享,为国际多中心遗传学研究提供可复用的政策框架与技术路径。

  

在健康研究领域,数据共享犹如打开科学发现的密码锁。由美国国立卫生研究院(NIH)资助的多基因风险方法多样化人群应用联盟(PRIMED Consortium),正致力于破解多基因风险评分(PRS)在全球化人群中的性能优化难题。

该联盟巧妙搭建了两条数据高速公路:通过协调数据库基因型和表型(dbGaP)申请流程实现标准化数据接入,同时制定联盟数据共享协议(CDSA)作为法律护栏。当原始数据因伦理或政策限制无法流动时,联邦分析技术(Federated Analyses)化身"数据隐形桥",允许分析算法在本地数据堡垒间穿梭运算。

技术团队将这套系统部署在NHGRI的分析可视化信息学实验室(AnVIL)云平台上,形成三层数据释放体系:个体级衍生数据、基因组摘要结果和方法工作流,每层都配备精确的权限控制系统。面对历史遗留数据集与动态演变的政策环境,研究者们提炼出可扩展的政策建议——比如建立动态知情同意机制和跨辖区数据治理框架,这些经验正为下一代国际研究联盟铺就基石。

值得注意的是,该研究揭示了"数据沉默区"现象:约17%的参与机构因历史同意书限制无法贡献个体数据,但通过开发元数据交换协议,仍使其纳入跨群体PRSmeta分析。这种灵活务实的解决方案,或将成为平衡科学进步与伦理合规的新范式。

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