甜菜加工厂中明串珠菌全基因组解析：揭示L. suionicum、L. mesenteroides与L. citreum的生态适应性及工业影响

为解决甜菜加工过程中明串珠菌(Leuconostoc)引发的蔗糖降解及生物膜污染问题，来自美国农业部农业研究署等机构的研究人员对10株分离自北美甜菜工厂的L. suionicum、L. mesenteroides和L. citreum进行全基因组测序，通过dDDH4>70%的物种鉴定标准及GTDB-Tk分析，揭示了其基因组特征与工业适应性，为生物膜防控提供分子基础。

　　

腐烂甜菜根部常见的明串珠菌(Leuconostoc)会在加工过程中污染甜菜汁，成为蔗糖降解和生产线故障的元凶。这项研究对10株源自北美甜菜工厂汁液和生物膜的菌株展开全基因组测序(WGS)，包括8株路氏明串珠菌(L. suionicum)、1株柠檬明串珠菌(L. citreum)和1株肠膜明串珠菌(L. mesenteroides)。

菌株复苏采用含20%甘油的MRS培养基，通过Zymo试剂盒提取DNA后，使用Element Biosciences的AVITI平台进行2×300 bp双端测序。数据经Galaxy平台处理，fastp质控后由Unicycler组装，SPAdes优化，QUAST评估显示基因组大小1.77-2.04 Mb，GC含量37.5-39.0%。CheckM验证基因组完整度>98%，GTDB-Tk和TYGS系统双重确认：8株L. suionicum与模式菌株DSM 20241的dDDH₄达83.3-90.2%，L. citreum 5-1株和L. mesenteroides 62-9株分别与标准菌株有94.9%和94.0%的匹配度。

表1详列了菌株特征：生物膜分离株14-9拥有最长的N50 contig（366,394 bp），而汁液分离株62-9展现最高测序深度（820×）。所有基因组已提交NCBI，如JBMMUQ（GCA_049629905.1）等。该研究为解析明串珠菌工业适应性提供了分子工具箱，其基因组数据将助力生物膜形成机制和抗菌策略开发。

（注：实验细节保留原技术术语如SPAdes、CheckM等，省略文献引用标识和图表标记）