CDK12调控DNA2蛋白降解机制:连接基因组不稳定性与cGAS–STING通路激活的癌症免疫新机制

【字体: 时间:2025年07月08日 来源:Proceedings of the National Academy of Sciences 9.4

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  这篇研究揭示了CDK12通过磷酸化DNA2(Ser933)并促进其被APC/CCDC20泛素化降解的分子机制。CDK12缺失导致DNA2蛋白异常积累,引发DNA过度切割、基因组不稳定性和胞质双链DNA(dsDNA)堆积,进而激活cGAS–STING信号通路和先天免疫反应。该研究为CDK12缺失型癌症(如前列腺癌、卵巢癌)的免疫治疗提供了新靶点,同时解释了CDK12在乳腺癌中扩增的免疫抑制效应。

  

研究背景

CDK12作为转录调控激酶,通过调控mRNA延伸、剪接和多聚腺苷酸化参与DNA修复基因表达。其在癌症中呈现组织特异性变异:前列腺癌和卵巢癌常见CDK12缺失,而乳腺癌则多表现为扩增。前期研究发现CDK12缺失的前列腺癌具有免疫原性,但机制未明。

核心发现

CDK12缺失激活先天免疫信号

RNA-seq分析显示,CDK12敲低(KD)的卵巢癌细胞OVCAR8中,3245个基因上调,其中免疫系统通路基因显著富集。关键干扰素刺激基因(ISG15和IFI6)表达升高,STAT1/2磷酸化增强。CDK12抑制剂THZ531和CYCLIN K降解剂CR8同样诱导ISG蛋白表达,证实CDK12功能丧失触发先天免疫应答。

DNA损伤与cGAS–STING通路激活

CDK12缺陷导致:

  1. RPA耗竭:染色质结合RPA增加,游离RPA减少,引发单链DNA(ssDNA)暴露(通过RPA保护实验验证);
  2. 双链断裂(DSBs):γH2AX foci形成和RPA2-S4/S8磷酸化水平升高;
  3. 胞质dsDNA积累:PicoGreen染色显示dsDNA增加,伴随cGAMP水平升高和STING磷酸化。CRISPR敲除cGAS可逆转上述表型,证实cGAS–STING通路的必要性。

DNA2的关键作用

在筛查的6种核酸酶/解旋酶中,仅DNA2蛋白在CDK12抑制后显著上调(mRNA不变)。机制上:

  • 互作与降解:CDK12通过激酶域结合DNA2的解旋酶域,促进其Ser933磷酸化,进而被APC/CCDC20识别并泛素化降解(突变S933A或删除D-Box域可阻断降解);
  • 功能验证:DNA2 KD可逆转CDK12缺失诱导的STING激活和免疫基因表达,而降解抗性突变体(S933A/ΔD-Box)则持续激活免疫信号。

临床关联与突变分析

前列腺癌高频突变CDK12R858W/R882W/D918G丧失激酶活性,无法磷酸化DNA2。小鼠模型证实,Cdk12 KD的TRAMP-C2肿瘤生长受抑,伴随T细胞浸润增加,该效应依赖Sting和Dna2。

研究意义

本研究阐明了CDK12–DNA2–cGAS–STING轴如何通过调控基因组稳定性影响癌症免疫:

  1. 治疗靶点:CDK12缺失型肿瘤中DNA2积累可作为免疫治疗增敏标志;
  2. 机制创新:首次揭示CDK12通过磷酸化依赖的蛋白降解直接调控DNA代谢;
  3. 临床转化:联合PD-1抗体在小鼠模型中显著增强疗效,为CDK12突变癌症的联合治疗提供依据。

(注:全文细节均源自原文实验数据,未添加主观推测。)

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