基于计算方法的SARS-CoV-2奥密克戎变种特异性表位鉴定与疫苗设计研究

为了解决COVID-19大流行中快速筛选疫苗候选的挑战，研究人员利用生物信息学方法开展了针对SARS-CoV-2奥密克戎变种的表位预测研究。结果表明，B细胞表位SVLYNLAPFFTFKCYG和T细胞表位RSYSFRPTY具有高度抗原性，分子对接显示其与HLA-B*15:01亲和力达-7.5 kcal/mol。这项研究为开发高效疫苗提供了新思路，助力应对变种威胁。

　　

在COVID-19大流行的背景下，SARS-CoV-2病毒引发了全球灾难，导致数百万感染和死亡。为快速开发疫苗，研究人员采用生物信息学方法预测保护性表位：通过ABCpred服务器进行连续B细胞表位分析，Ellipro算法预测不连续B细胞表位，NetCTL服务器评估T细胞表位。结果发现20个B细胞表位中11个高度抗原性，SVLYNLAPFFTFKCYG脱颖而出；6个T细胞表位中“RSYSFRPTY”最适合研究，覆盖72.42%人口。使用PEP-FOLD3服务器建模肽结构，通过同源建模确定HLA（主要组织相容性复合物）分子3D结构，AutoDock Vina分子对接显示“RSYSFRPTY”与HLA-B*15:01结合亲和力达-7.5 kcal/mol，PyMOL可视化揭示结合位点。最终结论是，“SVLYNLAPFFTFKCYG”和“RSYSFRPTY”作为非过敏、无毒表位，具有潜力激发针对奥密克戎变种的免疫反应，为疫苗设计铺平道路。