基于RNA-seq数据的阿片成瘾患者NRXN3基因变异鉴定及其在OUD中的潜在作用

为解决阿片使用障碍(OUD)遗传机制研究中的基因组数据局限问题，研究人员利用NCBI GEO数据库(PRJNA492904)的RNA-seq数据，对腹侧中脑样本中BDNF、DRD2等8个基因进行变异分析，发现NRXN3基因变异频率最高，揭示了RNA-seq在变异检测中的可靠性及NRXN3在OUD中的潜在调控作用。

　　

下一代测序技术(NGS)的迅猛发展为基因组变异检测带来了革命性突破，但在单核苷酸多态性(SNP)识别方面仍受限于高质量数据的可获得性。阿片使用障碍(OUD)作为一种以反复发作为特征的慢性疾病，其遗传变异研究长期面临样本匮乏的挑战。这项开创性研究另辟蹊径，通过分析NCBI SRA数据库(登录号PRJNA492904)中阿片成瘾者死后腹侧中脑组织的RNA测序(RNA-seq)数据，将转录组变异作为全基因组SNP分析的替代指标。研究团队重点考察了与神经突触功能密切相关的NRXN3基因——该基因既往已被证实与阿片成瘾及冲动行为存在关联，同时对比分析了BDNF(脑源性神经营养因子)、DRD2/DRD3(多巴胺受体)、OPRD1/OPRM1(阿片受体)及NGFB(神经生长因子β)等7个候选基因。令人振奋的是，实验结果证实NRXN3确实展现出显著高于其他基因的变异负荷，这一发现不仅强化了RNA-seq技术在变异检测中的实用价值，更通过分子证据将NRXN3推向了OUD发病机制研究的核心舞台。