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炎症性肠病相关结直肠癌中AQP9与IFITM1驱动免疫浸润及肿瘤进展的机制:从计算生物学到实验验证
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月09日 来源:Naunyn-Schmiedeberg's Archives of Pharmacology 3.1
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为解决炎症性肠病(IBD)相关结直肠癌缺乏有效生物标志物的问题,研究人员通过整合RNA测序(GSE165512)与机器学习(XGBoost),筛选出AQP9、IFITM1等关键基因。验证实验显示ITGA5(AUC=0.856)和CXCL8(AUC=0.786)诊断效能突出,小鼠模型证实靶基因显著高表达(P<0.0001)。该研究为IBD癌变机制及精准诊疗提供了新靶点。
慢性肠道炎症疾病(IBD)与结直肠癌发生密切相关,但现有诊疗手段效果欠佳。这项研究采用多组学联合作战策略:首先对170例样本(GSE165512)进行RNA测序分析,在克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)中分别揪出1361和4916个差异表达基因。通过维恩图"捉迷藏"游戏,锁定428个共同上调的"嫌疑分子"和562个沉默的"卧底基因"。
机器学习界的"超级侦探"XGBoost出马后,以88%的总体准确率(对照组93%)筛选出9个关键基因,其中水通道蛋白9(AQP9)和干扰素诱导跨膜蛋白1(IFITM1)表现抢眼。血液样本验证(GSE169568)时,整合素α5(ITGA5)和白介素8(CXCL8)展现出优异的诊断潜力(AUC>0.78)。更令人振奋的是,在葡聚糖硫酸钠(DSS)和抗CD40抗体诱导的小鼠结肠炎模型中,这些靶基因像"失控的喇叭"般显著高表达(P<0.0001)。
cBioPortal数据库挖掘显示,在结肠腺癌中这些基因存在1-3%的突变率。进一步的通路分析揭开了更精彩的剧情——AQP9和IFITM1不仅参与上皮间质转化(EMT)的"变形记",还活跃在PI3K/Akt信号通路的"情报传递"中,更与肿瘤微环境的"免疫细胞大迁徙"密切相关。这些发现为开发新型液体活检标志物和靶向治疗提供了分子路标。
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