内蒙古大规模牛场沙门氏菌流行特征及多重耐药基因blaTEM-1的传播机制研究

本研究针对内蒙古地区牛源沙门氏菌(Salmonella)的流行现状及耐药性展开系统调查，首次揭示该地区85.71%牛场存在沙门氏菌污染，分离株多重耐药率高达90.51%，β-内酰胺酶基因blaTEM-1携带率达100%。研究通过全基因组测序(WGS)解析耐药基因谱，为防控食源性病原体传播提供关键数据支撑。

　　

在被誉为中国"肉罐"和"奶罐"的内蒙古，畜牧业蓬勃发展背后隐藏着一个严峻挑战——抗生素滥用导致的耐药菌株蔓延。作为重要的人畜共患病原体，沙门氏菌(Salmonella)不仅引发牛群腹泻和乳腺炎，更通过食物链威胁人类健康。尤其令人担忧的是，这个占全国牛奶产量20%的黄金奶源带，此前竟缺乏系统的沙门氏菌耐药性监测数据。

内蒙古农业大学兽医学院联合农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室的研究团队，历时两年对28个规模化牛场展开调查。研究人员采集1357份直肠拭子和牛奶样本，采用CLSI和NARMS标准进行药敏试验，结合PCR检测21种耐药基因，并对代表性菌株S. enterica-NMGS9进行全基因组测序。这项发表在《BMC Veterinary Research》的研究，首次绘制了内蒙古牛源沙门氏菌的耐药图谱。

研究团队运用三大关键技术：1) 分层随机抽样法获取28个牛场的1357份生物样本；2) 基于GB 4789.4-2016标准的分离鉴定流程，结合invA基因PCR验证；3) 整合Kirby-Bauer药敏试验、多重PCR检测和Illumina NovaSeq全基因组测序技术平台。

主要发现
沙门氏菌流行特征
在85.71%的受检牛场中检出沙门氏菌，总分离率达12.97%。KN农场污染率最高(67.5%)，DH农场最低(2.86%)。从757份牛奶样本中分离出108株(61.36%)，显著高于直肠拭子样本(P<0.01)。

耐药谱分析
152株(96.20%)对磺胺异噁唑(SOX)耐药，128株(81.01%)对链霉素(STR)耐药。令人震惊的是，143株(90.51%)表现为多重耐药(MDR)，其中48.10%的菌株同时耐受5-8类抗生素，更有44.44%的菌株对9-16种药物产生耐药性。

耐药基因图谱
所有MDR菌株均携带β-内酰胺酶基因bla_TEM-1，90.21%检出氯霉素外排泵基因cmlA。全基因组测序显示NMGS9菌株携带14种耐药基因，包括四环素外排泵基因tetB和磺胺类耐药基因sul1/sul3。值得注意的是，虽然多粘菌素B(POL)敏感率为100%，但质粒介导的喹诺酮外排泵基因oqxA/oqxB检出率高达85%。

基因组特征
COG功能注释显示，NMGS9菌株的基因主要富集于碳水化合物转运代谢(691个)和细胞壁生物合成(466个)。毒力因子预测揭示，150个铁摄取系统基因占非特异性毒力因子的88.24%，提示该菌株具有强大的环境适应能力。

这项研究敲响了多重耐药沙门氏菌在食物链中传播的警钟。研究发现，内蒙古牛场沙门氏菌的bla_TEM-1基因携带率高达100%，与临床常用β-内酰胺类抗生素的失效直接相关。更值得关注的是，耐药基因的传播不仅源于抗生素选择压力，还可能通过RND家族外排泵(opxR/opxA)等固有代谢基因的适应性进化实现。

研究成果为建立我国动物源耐药菌监测网络提供了关键基线数据。作者建议：1) 加强磺胺类和氨基糖苷类药物的使用监管；2) 将bla_TEM-1基因纳入常规监测指标；3) 开展跨物种传播风险评估。这项研究不仅填补了内蒙古地区食源性病原体耐药性研究的空白，更为制定"同一健康"框架下的抗生素管理策略提供了科学依据。