细菌分类新篇:基于全基因组的Saccharothrix系统发育重评估及两新亚种提案
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时间:2025年07月09日
来源:Current Microbiology 2.3
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本研究旨在澄清Saccharothrix yanglingensis与Saccharothrix longispora的分类关系。来自未知单位的研究人员通过全基因组分析揭示,16S rRNA相似度达99.3%(超98.6%阈值),ANI、AAI均超97%,dDDH值75.1%,均超物种界定标准(95–96% ANI/AAI,70% dDDH),表型分析证实共享特征及代谢差异,提议将二者重分类为S. longispora subsp. longispora subsp. nov.和S. longispora subsp. yanglingensis subsp. nov., comb. nov.,为细菌分类提供精准框架。
研究人员深入探索了Saccharothrix yanglingensis和Saccharothrix longispora之间的分类谜团。通过比较16S rRNA基因序列,发现二者相似度高达99.3%,远超细菌物种界定的98.6%门槛。全基因组分析更揭示惊人遗传关联:平均核苷酸同一性(ANI)和平均氨基酸同一性(AAI)均突破97%,数字化DNA-DNA杂交(dDDH)值达75.1%,这些指标全部超越标准阈值(ANI/AAI 95–96%,dDDH 70%)。表型研究锦上添花,突显了共享的形态生理特性,同时捕捉到代谢能力的微妙差异。基于这些证据,科学界将Saccharothrix yanglingensis Yan et al. 2025和Saccharothrix longispora重新归类,确立为同一物种下的两个独特亚种:Saccharothrix longispora subsp. longispora subsp. nov.以及Saccharothrix longispora subsp. yanglingensis subsp. nov., comb. nov.,为微生物进化拼图添上关键一块。
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