综述:将机器学习整合到肌炎研究中的系统评价

【字体: 时间:2025年07月09日 来源:Clinical Reviews in Allergy & Immunology 8.4

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  这篇综述系统评价了机器学习(ML)在特发性炎症性肌病(IIM)研究中的应用进展,涵盖影像分析(MRI/US)、癌症/间质性肺病(ILD)风险预测、生物标志物筛选及治疗反应评估等领域。通过23项原始研究分析,发现监督学习模型(如LR、RF、SVM、CNN)在区分IIM亚型(如DM、PM、IMNM)和预测并发症中表现优异(AUC-ROC最高达0.977),但存在数据集偏倚和临床转化挑战。多模态数据整合(如转录组+影像)为精准医疗提供了新方向。

  

引言

特发性炎症性肌病(IIM)是一组以近端肌无力和肌肉外表现为特征的自身免疫性风湿病,包括皮肌炎(DM)、多发性肌炎(PM)、免疫介导的坏死性肌病(IMNM)和包涵体肌炎(IBM)等亚型。2017年EULAR/ACR分类标准进一步纳入幼年型肌炎(JM)等表型,但疾病异质性和预后差异仍待探索。机器学习(ML)作为新兴工具,通过分析影像、血清标志物和转录组数据,为IIM的精准诊断和分层治疗提供了可能。

方法

研究遵循PRISMA指南,筛选2014-2025年PubMed数据库的34篇文献,最终纳入23项原创研究。纳入标准包括:聚焦IIM、使用ML模型(如LR、RF、SVM、CNN)并报告性能指标(如AUC-ROC)。排除非肌炎研究或缺乏定量数据的文献。

ML在IIM中的应用

临床影像分析

肌肉超声(US)和磁共振成像(MRI)是评估IIM的重要工具。Burlina等开发深度学习(DL)模型,通过US图像区分对照组与IIM患者(IBM vs. DM/PM),准确率达79.2%。


Fabry等利用1-Lipschitz神经网络分析全身MRI,区分面肩肱型肌营养不良(FSHD1)与IIM,准确率73.66%,与放射科医师相当。Kabeya的CNN模型通过肌肉活检切片分类IIM亚型(ASS、IBM、DM、IMNM),AUC-ROC达0.977,超越9名医师的判读水平。

癌症与ILD风险预测

抗TIF1-γ抗体阳性IIM患者癌症风险显著升高(54%在诊断后6个月内发生)。Zhao等通过RF模型筛选关键变量(疾病持续时间、淋巴细胞百分比等),将患者分为低、中、高风险组,准确率>90%。Zhang的LR模型证实抗TIF1-γ是癌症最强预测因子(风险增加5倍),而ILD是其负相关因素。
抗MDA5抗体阳性DM-ILD患者死亡率高,Li等开发的LR模型预测3个月死亡率的AUC-ROC为0.866。Xue的RF算法通过临床指标早期识别幼年DM中的抗MDA5阳性亚型(AUC-ROC 0.975)。

生物标志物筛选

Pinal-Fernandez等通过线性SVM分析肌肉活检转录组,区分IIM亚型(准确率91%),发现NDUFAF7、POLR2J等基因与IMNM相关。Wang等结合LASSO回归和WGCNA,鉴定干扰素刺激基因15(ISG15)为DM皮肤病变的标志物(AUC-ROC 0.950),其表达与M1巨噬细胞浸润正相关。

治疗反应预测

Danieli等发现IVIg/SCIg治疗反应与肌酸激酶(CK)和肌炎疾病活动指数(MITAX)显著相关(AUC-ROC 0.89)。Wu的LR模型证实血清生长分化因子15(GDF15)水平与IIM活动性指标(CK、CRP等)呈正相关。

挑战与展望

当前研究局限性包括数据集偏倚(95.7%存在高风险偏倚)、缺乏外部验证及标准化报告。未来需整合多组学数据(如转录组+影像组学)和可解释AI框架,以推动临床转化。

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