多组学因子分析揭示肾移植中生物过程的跨区室复杂性

为解决肾移植后同种异体移植物损伤的复杂机制问题，研究人员通过多中心研究整合六种组学数据（170,000变量），采用多组学因子分析（MOFA）技术，揭示了与排斥反应相关的八种潜在因子，包括免疫谱、补体激活等，为移植医学提供了新的生物学框架。

　　

肾移植是终末期肾病患者的首选治疗方式，但长期成功受限于免疫排斥、移植物损伤等复杂问题。尽管高通量技术为解析这些机制提供了可能，但跨组学数据的整合仍面临挑战。为此，来自欧洲多中心（包括比利时鲁汶大学医院、德国汉诺威医学院等）的研究团队在《Kidney International》发表研究，通过多组学因子分析（MOFA）技术，首次系统揭示了肾移植中生物过程的跨区室互作网络。

研究基于BIOMARGIN项目的131例肾移植患者样本，整合血液、尿液和移植物活检的六种组学数据（包括表观遗传学miRNA、转录组mRNA等），应用MOFA2算法进行无监督分析。关键技术包括：多中心队列样本采集（欧洲四家医院）、高通量测序（RNA-seq）、微阵列（MicroArray）及RT-qPCR验证。

结果部分

1. MOFA识别八种潜在因子：分析发现八种跨组学驱动因子，其中Factor 1和Factor 3分别与排斥反应相关免疫细胞浸润（如T细胞、巨噬细胞）和补体激活通路显著关联。
2. 免疫治疗相关特征：Factor 5揭示了诱导治疗导致的免疫修饰，如调节性T细胞（T_reg）比例变化。
3. 跨区室分子互作：尿液与血液中的TGF-β₁表达与移活检瘢痕程度呈正相关，提示非侵入性标志物潜力。

结论与意义
该研究通过MOFA2首次构建了肾移植多组学互作网络，将临床表型与分子机制直接关联。发现的因子不仅为排斥亚型分类提供新依据（如补体激活因子可作为抗体介导排斥的辅助标志物），还揭示了免疫治疗响应的潜在靶点。此外，跨组学整合策略为其他复杂疾病研究提供了范式。

研究局限性包括样本量对罕见排斥亚型的覆盖不足，但公开的数据集（如figshare平台）为后续验证奠定基础。欧洲第七框架计划（FP7）和ERACoSysMed-2等基金支持了该跨学科合作，凸显系统医学在移植领域的价值。