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Dishevelled-1(DVL1)与ETS1转录因子协同调控全局转录组变化:揭示Wnt信号通路中核DVL1的转录调控新机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月09日 来源:Nature Communications 14.7
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本研究针对核Dishevelled-1(DVL1)在转录调控中的分子机制这一关键科学问题,通过整合RNA测序(RNA-seq)和染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)技术,首次揭示了DVL1通过结合ETS1转录因子靶向特定基因组位点,从而全局调控基因表达的新机制。研究发现DVL1表达变化可影响超过50%的转录组,且与肿瘤发生、免疫调节等病理过程密切相关,为理解Wnt信号通路中DVL1的核功能提供了重要理论依据。
在生命科学领域,Wnt信号通路如同交响乐团的指挥,协调着细胞增殖、分化和迁移等关键生命活动。Dishevelled(DVL)蛋白家族作为该通路的核心支架蛋白,长期被认为仅发挥胞质功能。然而近年研究发现,DVL能穿梭至细胞核内,但其核内作用机制仍是未解之谜——它如何影响基因表达?是否存在转录因子伙伴?这些问题直接关系到对发育异常和癌症等疾病机制的认知。
美国德克萨斯大学健康科学中心(University of Texas Health Science Center)的研究团队在《Nature Communications》发表突破性成果。他们通过多组学联用技术,首次绘制出DVL1的全基因组结合图谱,并揭示其通过ETS1转录因子靶向调控基因表达的分子机制。关键技术包括:1)采用MDA-MB-231三阴性乳腺癌细胞模型进行DVL1过表达和敲除实验;2)整合RNA-seq和ChIP-seq分析全局转录变化与DNA结合位点;3)通过免疫共沉淀(Co-IP)验证DVL1-ETS1蛋白互作;4)利用染色质免疫共沉淀(ChIP-reChIP)证实共定位现象;5)结合SIRT1抑制剂探究表观遗传调控机制。
RNA-seq分析显示,DVL1过表达(DVL1OE)使11,114个基因发生显著差异表达(padj<0.05),其中5,399个上调、5,715个下调。这些基因涉及细胞迁移(如MMP1)、免疫调节(如CXCR4)等通路,且8个线粒体tRNA异常表达,提示DVL1调控范围远超预期。

ChIP-seq揭示DVL1在启动子区(如Wnt通路基因)、增强子标记(H3K27ac、H3K4me1)区域广泛富集。特别在ETS1调控基因(BMP2、PTEN等)启动子区发现共有motif,暗示转录因子协作可能。
通过LOLA分析预测35个潜在互作转录因子,其中ETS1在MDA-MB-231中高表达。Co-IP证实核内DVL1-ETS1直接互作,ChIP-reChIP显示二者在BMP2等基因启动子区共定位。关键发现是:ETS1敲除虽不影响自身结合,但使DVL1从这些位点完全消失,证明DVL1依赖ETS1进行基因组定位。
SIRT1抑制剂处理导致DVL1和ETS1从靶基因启动子解离,显著改变基因表达模式。这提示SIRT1介导的乙酰化修饰可能调控该复合体的稳定性。
这项研究首次系统阐释了核DVL1通过ETS1实现基因特异性调控的分子机制,突破了传统认知中DVL仅作为Wnt通路胞质支架蛋白的局限。发现DVL1-ETS1-SIRT1三元复合体的调控网络,不仅为理解Robinow综合征等发育疾病提供新视角,更为三阴性乳腺癌等恶性肿瘤的靶向治疗开辟了新思路。该成果将推动针对DVL1核转运和转录调控功能的药物研发,具有重要的理论和临床价值。
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