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家蚕核型多角体病毒P6E株全基因组测序揭示独特bro基因组合及其表达载体应用价值
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月09日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7
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来自日本国立蚕业昆虫科学研究所的研究人员完成了家蚕核型多角体病毒(BmNPV) P6E株的全基因组测序。该病毒基因组为126,727 bp环状双链DNA,GC含量40.2%,含141个ORF,其独特的bro-paralog基因组合为杆状病毒表达系统开发提供了新资源,对蚕业病害防控和蛋白质生产平台优化具有重要意义。
这项研究揭示了家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus, BmNPV) P6E株的完整基因组图谱。这个被改造为蛋白质表达载体的病毒株,其基因组呈现126,727 bp的环状结构,GC含量40.2%,携带141个开放阅读框。有趣的是,该毒株拥有独特的bro基因组合(bro-a、bro-c和bro-d),这种特征与日本本土其他毒株迥异,却与中国C2株、浙江株及印度株等亚洲大陆分离株高度相似。
研究人员采用纳米孔测序技术(Oxford Nanopore MinION)和Illumina NovaSeqX双平台策略,通过未片段化的长读长测序获得N50达16.26 kb的数据,结合Flye组装和medaka抛光,最终获得覆盖深度172倍的高质量基因组。与参考毒株T3相比,P6E株基因组相似度达98.91%,同时保留了8个hr区域(hr1-hr5)和杆状病毒科38个核心基因。
作为蚕业重要病原体,BmNPV能感染家蚕幼虫造成重大经济损失。但另一方面,基于该病毒和家蚕宿主的表达系统,自Maeda团队开创性工作以来,已成为生产科研和工业用蛋白的利器。本研究解析的P6E株基因组,为优化杆状病毒表达载体(Baculovirus Expression Vector System, BEVS)提供了分子基础,其独特的基因组合可能影响病毒宿主互作机制,对开发新型生物制剂具有潜在价值。
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