揭示lncRNA SNHG1通过ULK1-Notch1轴介导酸性胆汁诱导EMT的新机制：Barrett's食管恶性进展的关键靶点

为解析Barrett's食管(BE)恶性进展中酸性胆汁盐诱导上皮间质转化(EMT)的分子机制，四川大学华西医院团队聚焦lncRNA SNHG1调控的自噬-Notch1信号互作网络。研究发现SNHG1通过增强ULK1-Notch1相互作用抑制自噬、激活EMT，驱动BE向异型增生进展。临床样本证实SNHG1在低/高级别异型增生患者中显著高表达，靶向该轴可逆转EMT表型，为BE复发防治提供新策略。

　　

论文解读

背景：隐匿的癌变威胁与未解之谜
Barrett's食管(BE)作为胃食管反流病(GERD)的严重并发症，以食管鳞状上皮被肠化柱状上皮替代为特征，显著增加食管腺癌(EAC)风险。尽管射频消融(RFA)可有效清除病变，但约10%患者每年出现复发，其元凶——隐匿于鳞状上皮下的肠化生(SSIM)——被认为与酸性胆汁盐诱导的上皮间质转化(EMT)密切相关。EMT使Barrett's细胞获得迁移侵袭能力，穿透基底膜形成SSIM"储备库"。然而，酸性胆汁盐如何精准调控EMT？自噬与Notch信号在其中扮演何种角色？这些关键问题亟待解答。

为此，四川大学华西医院的研究团队通过细胞模型、动物实验及临床队列，首次揭示长链非编码RNA(lncRNA) SNHG1通过ULK1-Notch1轴介导自噬抑制与EMT激活的分子机制。这一成果发表于《Molecular Biomedicine》，为阻断BE恶性转化提供了新靶点。

关键技术方法
研究结合多维度技术：①采用BAR-T/CP-C细胞模型模拟酸性胆汁盐(ABS)慢性暴露（30分钟/天×14天），通过划痕愈合、Transwell实验评估EMT表型；②利用Western blot、免疫荧光、透射电镜及mRFP-GFP-LC3双荧光报告系统检测自噬流变化；③通过蛋白对接预测、Co-IP验证ULK1-Notch1互作；④基于GEO数据库(GSE26886)进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选关键lncRNA；⑤在p16^flox/flox/Kras^G12D基因工程小鼠模型中诱导Barrett's样病变，并构建鳞柱交界(SCJ)类器官进行SNHG1功能验证；⑥纳入20例BE患者内镜活检样本（非进展组 vs 低/高级别异型增生组），通过qPCR分析SNHG1临床相关性。

研究结果
1. 酸性胆汁盐通过Notch1信号通路诱导EMT
慢性酸性胆汁盐暴露(AB14D)显著增强BAR-T/CP-C细胞的迁移与侵袭能力，伴随E-cadherin下调及N-cadherin、Vimentin、MMP-2/9、核Snail上调。公共数据集分析显示Notch1在BE组织中下调而在EAC中再激活，KEGG富集提示Notch通路是BE进展的核心驱动者。机制上，酸性胆汁盐激活Jagged1/Notch1信号，Notch1敲除可逆转EMT表型，证实其必要性。

2. 自噬通过Notch1抑制调控EMT
短时胆汁暴露(AB30M)提升自噬流（LC3-II↑, p62↓），但慢性暴露(AB14D)显著抑制自噬（自噬小体↓）。激活自噬的雷帕霉素(RAPA)处理使LC3-II↑/p62↓，同时逆转EMT表型：迁移/侵袭能力↓、N-cadherin↓/E-cadherin↑，并抑制Notch1/Snail表达。表明自噬通过降解Notch1细胞内域(NICD)阻断EMT。

3. ULK1-Notch1轴介导自噬-EMT串扰
ULK1作为自噬启动关键激酶，其磷酸化(p-ULK1-Ser⁷⁵⁷)受mTOR调控。蛋白对接分析显示ULK1与Notch1存在强结合（打分99.059），Co-IP验证二者直接互作。γ-分泌酶抑制剂DAPT抑制Notch活化后，p-ULK1↓/LC3-II↑；联合RAPA可协同增强自噬、抑制EMT，证实ULK1-Notch1轴是自噬与EMT的交叉枢纽。

4. SNHG1临床关联性及其调控机制
WGCNA筛选出与BE进展最相关的turquoise模块（含ULK1/Notch1），进一步锁定SNHG1为关键lncRNA。临床样本显示SNHG1在进展至低/高级别异型增生患者中显著高表达。功能上，SNHG1过表达增强ULK1-Notch1互作（Co-IP验证），促进p-ULK1↑/LC3↓/p62↑，激活EMT；而SNHG1敲除则逆转该效应。RAPA或DAPT处理可阻断SNHG1的促EMT作用，证实其依赖ULK1-Notch1轴。

5. 动物模型验证
在p16^flox/flox/Kras^G12D小鼠中，胆汁酸(BA)慢性暴露成功诱导SCJ组织炎症与肠化生。SCJ类器官实验显示：SNHG1过表达导致E-cadherin↓/N-cadherin↑，而SNHG1敲除则相反，证实其在体内调控EMT的核心作用。

结论与意义
本研究首次阐明"SNHG1-ULK1-Notch1"调控轴在Barrett's食管恶性进展中的核心作用：慢性酸性胆汁盐暴露上调SNHG1，通过增强ULK1与Notch1的相互作用，抑制自噬并激活EMT，驱动肠化生向异型增生演变。其转化价值在于：

1. 诊断层面：SNHG1可作为预测BE进展的新型生物标志物，尤其适用于RFA术后复发风险评估；
2. 治疗层面：靶向SNHG1或ULK1-Notch1轴（如RAPA/DAPT联用）可同时激活自噬并抑制EMT，为阻断BE癌变提供多靶点干预策略；
3. 机制创新：突破性揭示lncRNA通过调控"自噬-EMT"动态平衡影响癌前病变演进，为消化道肿瘤预防研究开辟新视角。

研究通过整合临床队列、类器官模型及多组学分析，将基础机制与临床转化紧密结合，为Barrett's食管患者的精准防治奠定理论基础。