slyA介导的大肠杆菌运动与分泌调控的转录组学解析：揭示抗菌靶点新机制

本研究针对slyA转录调控因子在Enterobacteriaceae中调节运动性和分泌的分子机制问题，研究人员利用公开RNA-Seq数据，分析了E. coli野生型和slyA敲除株的转录组差异。结果识别出925个显著差异表达基因，包括鞭毛通路关键基因如fliA、flhB和flgM，并发现运动性、趋化性和蛋白分泌过程受显著调制。该研究为slyA调控网络提供计算基础，并指向新型抗菌开发靶点，具有重要转化医学意义。

　　研究人员深入探索了slyA（属于MarR家族的转录调控因子），它广泛参与调控Enterobacteriaceae中的毒力、应激响应和运动性等关键过程。基于大肠杆菌(E. coli) BW25113野生株及其同基因slyA敲除株的转录组分析，利用公开RNA-Seq数据（每个四组生物学重复），我们通过差异基因表达分析，识别出925个显著改变的基因，其中包括鞭毛组装通路的核心成员如fliA（鞭毛特异性转录因子）、flhB（鞭毛钩基复合体蛋白）和flgM（抗σ因子）。基因本体论(GO)和富集分析揭示了细菌运动性、趋化性以及蛋白分泌等生物过程的强烈调制。网络分析进一步突显了涉及运动与分泌的枢纽基因子集，暗示它们在slyA介导调控中的中枢作用。尽管这些发现表明slyA影响多条细胞通路，但调控效应可能兼具直接与间接机制。这项转录组研究不仅为未来slyA相关分子机制探索奠定计算基础，还标识出潜在抗菌药物开发靶点路径。