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土耳其特有石竹属植物(Dianthus)的系统发育分析:基于nrDNA ITS与cpDNA rbcL序列的分子证据
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月10日 来源:Genetic Resources and Crop Evolution 1.6
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本研究通过核DNA内转录间隔区(ITS)和叶绿体DNA rbcL基因序列,解析了土耳其特有石竹属植物Dianthus zederbaueri、D. varankii、D. halisdemirii和D. goekayi的系统发育关系。研究人员采用ITS4-ITS5A和rbcLaF-rbcLaR引物进行PCR扩增,结合MEGA 11软件分析显示:ITS序列核苷酸多样性(π=0.001543)支持D. halisdemirii与D. superbus聚枝,而rbcL序列(π=0.000000)揭示了D. zederbaueri与D. varankii的亲缘性。该研究为石竹属分类及Caryophyllaceae科演化研究提供了重要分子依据。
这项研究聚焦土耳其特有的四种石竹属植物——Dianthus zederbaueri、D. varankii、D. halisdemirii和D. goekayi,采用双基因标记策略展开系统发育解密。科研团队分别提取核DNA的内转录间隔区(ITS)和叶绿体rbcL基因序列,通过ITS4-ITS5A和rbcLaF-rbcLaR引物进行PCR扩增,经Sequencer 5.4.6软件精细编辑后,借助MEGA 11平台完成核苷酸组成分析、遗传距离矩阵计算及多样性指数(π)测定。
有趣的是,ITS数据(π=0.001543)显示D. halisdemirii与广布种D. superbus形成姐妹群,而D. zederbaueri则与D. aculeatus聚枝;相比之下,高度保守的rbcL序列(π=0.000000)仅能确认D. zederbaueri与D. varankii的近缘关系。当研究视野扩展到NCBI数据库收录的Caryophyllaceae科植物(包括Gypsophila、Silene等属)时,这些土耳其特有种竟与Petrorhagia、Gypsophila和Saponaria聚为一支,暗示了石竹属与这些类群存在深度的演化纠缠。该成果不仅为土耳其生物多样性保护提供科学依据,更揭示了石竹属在石竹科中的独特系统位置。
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