2023年杭州地区流感样病例中肠道病毒的分子流行病学特征及共感染模式研究

本研究针对中国新冠疫情管控放开后的首个年度（2023年），系统分析了杭州地区流感样病例（ILI）中肠道病毒（EVs）的流行特征。研究人员通过3480例咽拭子样本检测，发现EV阳性率为3.74%，其中CV-A6（60.44%）为优势基因型，夏季（7月达10.13%）和秋季为流行高峰，0-7岁儿童为主要易感人群。研究首次揭示了EV与12种呼吸道病原体的共感染模式（HRV和SP为主要共病原体），并通过VP1基因进化分析证实CV-A4、CV-A6和CV-A10分别属于C2、D3和C1亚基因型。该成果为EV防控策略制定提供了重要科学依据。

　　

研究背景
肠道病毒（Enteroviruses, EVs）作为全球范围内重要的病原体，不仅能引发手足口病等典型症状，还与流感样病例（Influenza-like illness, ILI）密切相关。随着中国新冠疫情防控政策于2022年底调整，2023年成为呼吸道传染病监测的关键时间节点。既往研究表明，EVs在夏季呈现明显季节性高峰，但疫情管控期间其流行规律发生显著改变——例如2021年杭州地区EV检出率高达10.35%，远高于常态水平。这种异常波动引发重要科学问题：后疫情时代EV的流行特征是否回归常态？哪些基因型将占据主导地位？共感染模式是否发生变化？

研究设计与方法
杭州市疾病预防控制中心（Zhejiang Key Laboratory of Multi-Omics in Infection and Immunity）的研究团队在2023年全年系统收集了3480例ILI患者的咽拭子样本，采用多重实时荧光PCR技术检测EVs及其他12种呼吸道病原体。对阳性样本通过VP1基因半巢式PCR（RT-snPCR）进行分型，并利用MEGA 11软件构建系统发育树分析进化特征。

关键结果

1. 流行病学特征
   检出EV阳性130例（3.74%），显著低于2021年疫情期（P<0.001）。流行呈现典型双峰模式：7月达峰值10.13%，10月出现次高峰7.36%。0-3岁组感染率最高（7.21%），且无性别差异（χ²=0.258, P=0.655）。

1. 基因型分布
   成功分型91株EVs，其中EV-A占94.51%（86/91）。CV-A6为绝对优势型（55/91），其次为CV-A4（26/91）。系统发育分析显示：

• CV-A4属于C2亚型（与原型株相似性83.8-85.0%）
• CV-A6全部为D3亚型（相似性83.8-86.1%）
• CV-A10归类于C1亚型（相似性76.5-76.8%）

1. 共感染模式
   75.82%（69/91）的EV阳性样本存在共感染，其中：

• 三重感染占比最高（48.8%）
• 人类鼻病毒（HRV, 42.03%）和肺炎链球菌（SP, 39.13%）为主要共病原体
• 值得注意的是，24.2%的病例仅检出EVs（主要为CV-A6和CV-A4），证实其独立致病能力

研究意义
该研究首次系统描绘了后疫情时代杭州地区EVs的流行图谱，揭示了CV-A6-D3亚型的持续优势地位及其与多种呼吸道病原体的复杂互作关系。研究结果提示：

1. 夏季防控应重点关注托幼机构，特别是针对0-3岁儿童
2. 将EV筛查纳入流感哨点监测可提升呼吸道传染病预警能力
3. CV-A4-C2和CV-A6-D3亚型的持续流行可能与其刺突蛋白（VP1）的适应性突变有关，需加强分子监测

这些发现为优化EV防控策略提供了关键科学依据，相关成果发表于《Virology Journal》，对全球新发传染病监测具有示范意义。