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基于LVDD9B蛋白结构解析的抗WSSV药物筛选与生态风险评估:水产养殖抗病毒治疗新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月10日 来源:In Silico Pharmacology
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针对水产养殖中白斑综合征病毒(WSSV)的防控难题,研究人员通过分子对接与动力学模拟技术,系统解析了虾类受体蛋白LVDD9B与病毒蛋白VP26的互作机制。研究发现Cuscuta reflexa来源的化合物(如Cosmosiin)具有优异结合稳定性、低生态风险及良好药代动力学特性,为开发靶向LVDD9B的抗WSSV疗法提供了理论依据。
专业翻译:
本研究通过计算机模拟技术深入探索了虾类受体蛋白LVDD9B的结构特征及其在抑制白斑综合征病毒(WSSV)中的应用潜力。利用SWISS-MODEL构建了128个氨基酸组成的LVDD9B三维结构,经ProSA和Ramachandran图验证其可靠性。该蛋白主要定位于细胞质和胞外区域,具有亲水性及保守的甲壳素结合位点。
通过HADDOCK 2.4服务器进行LVDD9B与WSSV衣壳蛋白VP26的蛋白-蛋白对接,发现二者通过氢键和盐桥形成强相互作用。分子动力学模拟显示复合物结构稳定,均方根波动(RMSF)值变化微小。结合自由能(MM/GBSA)计算证实结合过程能量有利。
药代动力学分析揭示,来自菟丝子(Cuscuta reflexa)的黄酮类化合物木犀草素(Luteolin)和槲皮素(Quercetin)具备良好生物利用度,而生态风险评估表明柯摩素(Cosmosiin)的生态毒性最低。主成分分析(PCA)表明蛋白-配体复合物构象稳定,其中异鼠李素糖苷(Isorhoifolin)呈现最低内能(-2099.4722 Hartree)与最高偶极矩(8.1833 Debye)。
前沿分子轨道分析显示,4.05–4.34 eV的HOMO-LUMO能隙影响化合物反应活性。分子静电势(MEP)和振动频率分析进一步支持了化合物稳定性与生物活性。综合表明,柯摩素、异鼠李素糖苷和阿福苷(Afzelin)因优异的药代特性与生态安全性,具备开发为靶向LVDD9B的抗WSSV药物的潜力。
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