瑞士多营养级食物网数据库trophiCH:整合2.6万物种实证数据,解析生态网络互作全景

【字体: 时间:2025年07月10日 来源:Scientific Data 5.8

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  本研究针对大尺度生态网络数据匮乏的挑战,整合瑞士1862-2023年文献与空间模型,构建了涵盖26,243个类群(含脊椎动物、无脊椎动物和维管植物)的物种级多营养级元食物网(metaweb)trophiCH,包含1,188,063条营养相互作用。通过栖息地共现和垂直分层策略优化物种级互作推断,30%互作源于实证记录。该数据库为解析环境梯度下食物网结构变化(如城市化、海拔)提供了数据驱动新范式,支持生物多样性保护与生态系统功能预测,已应用于eDNA和物种分布模型研究。

  

论文解读

在瑞士阿尔卑斯山麓,一只红松鼠的种群波动可能牵动整片森林的生态平衡——它的食物来源(松果)、寄生虫(蜱虫)和天敌(苍鹰)共同编织成复杂的营养网络。然而,传统生态学研究受限于局部观测和数据碎片化,难以捕捉国家尺度下物种互作的全景。尤其对于昆虫、土壤生物等类群,营养关联的记录严重缺失,导致气候变化和土地利用对生态网络的扰动机制长期模糊。瑞士联邦森林、积雪与景观研究所(WSL)和苏黎世联邦理工学院(ETH Zürich)的研究团队历时三年,整合百年生态记录与创新推断模型,首次构建了覆盖瑞士全域的多营养级物种互作数据库trophiCH,以数据驱动的方式揭开了“谁吃谁”的生态黑箱,成果发表于《Scientific Data》。

研究团队通过文献挖掘与空间建模双轨并行的技术路线:①系统检索1862-2023年732份文献与数据库(如GloBI、Animal Diversity Web),提取物种互作记录;②基于瑞士国家物种数据库(InfoSpecies)的40万条分布数据,结合栖息地关联性(TypoCH分类)和垂直分层(如地表、植被、水体)策略,将高阶分类单元(科/属级)的互作信息推断至物种级;③利用栖息地共现原则("物种A摄食属B则可能摄食同域物种C")填补数据缺口。最终整合26,243个分类单元(含125个基础营养类群如食真菌者)和118万条互作关系,其中30%为实证记录。

数据分布特征


如图1所示,无脊椎动物占物种总数的84%(21,248种),但59%的互作涉及脊椎动物。食草和授粉互作占比最高(合计超60万条),而寄生和捕食记录集中于实证数据。关键数据缺口体现在甲虫(鞘翅目)和双翅目昆虫,约4,300种缺乏食源信息。

数据质量控制


通过数字化流程自动化处理(错误率≈0%)与纸质记录抽样验证(95%置信区间错误率0.04–0.35%,图3),确保数据可靠性。针对营养链断层(如5,581种误标为基底物种),采用近缘种生态位替代策略补全574种捕食者关联。

网络结构对比


与全球18个现存元食物网相比(图4),trophiCH的物种数(26k)为第二名的5倍,平均连接度(45.2)和异质性(标准差152.3)均处于多营养级网络合理区间(残差在±2σ内),验证其数据覆盖的科学合理性。

结论与意义
trophiCH的核心突破在于三重价值:

  1. 方法学创新:建立“实证记录+空间推断”的可扩展框架,突破传统模型依赖形态或系统发育假设的局限,为高分辨率生态网络研究提供模板;
  2. 跨尺度应用:已支持eDNA构建城市化梯度食物网(揭示水陆系统解耦)、物种分布模型(SDM)推演1.8万集水区网络,证实海拔与土地利用主导食物网结构变异;
  3. 保护实践:通过拓扑指标(如介数中心性)识别关键物种,评估栖息地丧失的级联灭绝风险。

正如通讯作者Loic Pellissier强调:“此数据库是理解生物多样性如何在空间和时间中重组的基础”。随着瑞士25米分辨率环境栅格数据的开放,trophiCH将持续推动从阿尔卑斯山到城市公园的生态预测,为全球生物多样性框架(GBF)的“30×30”目标提供科学锚点。

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