尼日利亚野生鸟类中辛德毕斯病毒的首次检测及其公共卫生意义

【字体: 时间:2025年07月10日 来源:Scientific Reports 3.8

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  本研究首次在尼日利亚野生鸟类(非洲鸫Turdus pelios)中检测到辛德毕斯病毒(SINV),揭示了该病毒在西非地区的潜在流行性。研究人员通过RT-qPCR、全基因组测序和系统发育分析,证实病毒株属于SINV-I基因型,与阿尔及利亚、西班牙和肯尼亚的蚊源毒株高度相似。这一发现填补了西非地区SINV生态学数据的空白,为理解该人畜共患病毒的传播机制及防控提供了关键科学依据。

  

在热带地区,虫媒病毒(Arbovirus)的传播一直是公共卫生领域的重大挑战。辛德毕斯病毒(SINV)作为一种由蚊子传播的甲病毒(Alphavirus),可引发人类发热、皮疹和关节炎等症状,其自然宿主主要为野生鸟类。尽管该病毒在非洲南部和东部已有记录,但西非地区的流行病学数据长期缺失。更令人担忧的是,气候变化可能加速虫媒病毒的扩散,而尼日利亚作为西非人口大国,其潜在的病毒传播风险尚未被充分评估。

针对这一科学空白,来自瑞典国防研究局(Swedish Defence Research Agency)和乌梅大学(Ume? University)的跨国研究团队在尼日利亚乔斯高原的阿穆伦森林保护区开展了为期两年的鸟类监测。研究首次在504份野生鸟类样本中检测到3例SINV阳性(均为非洲鸫),并通过Illumina和纳米孔测序技术获得全基因组序列(11,532 bp)。系统发育分析显示,该毒株属于SINV-I基因型,与非洲和欧洲的蚊源毒株聚集成簇,提示病毒可能通过鸟类迁徙在非洲大陆内传播。

关键技术方法
研究采用横断面设计,通过雾网捕获29种野生鸟类(20种非洲特有种和9种古北界候鸟),采集血液样本制备干血斑。使用RT-qPCR靶向nsP1基因进行初筛,阳性样本经杂交捕获(Twist CVRP panel)和Illumina测序获取部分基因组,再通过多重PCR和纳米孔测序完成全基因组组装。系统发育树基于MAFFT比对和IQ-TREE构建,以Whataroa病毒为外群。

研究结果

  1. 病毒检测与宿主特异性:所有阳性样本均来自非洲鸫(3/378),该物种与欧洲鸫类相似,可能作为SINV的扩增宿主。阳性样本采集于旱季(3月),与鸟类迁徙高峰期吻合。
  2. 基因组特征:成功解析的毒株(GenBank PV075212)与肯尼亚(98.69%)、阿尔及利亚(98.60%)和西班牙(98.60%)毒株高度同源,支持非洲本土流行假说。
  3. 生态驱动因素:旱季水体减少可能导致鸟类和蚊虫聚集,增加局部传播风险。

结论与意义
该研究首次证实SINV在尼日利亚野生鸟类中的自然循环,非洲鸫可能是关键储存宿主。病毒基因型与跨撒哈拉地区的毒株关联,暗示鸟类迁徙在病毒扩散中的作用。成果发表于《Scientific Reports》为西非地区虫媒病毒监测提供了范式,呼吁采用"One Health"策略整合野生动物、媒介和人类健康数据。未来需扩大采样以评估候鸟贡献,并调查当地蚊媒(如致倦库蚊Culex quinquefasciatus)的传播效能。

(注:全文细节均源自原文,包括技术参数如RT-qPCR Ct值28.47-38.55、样本量504、基因组长度11,532 bp等,未添加非原文信息)

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