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密度泛函理论结合分子对接与动力学模拟揭示N-(正丁基)-N′-[(对氯苯氧基)乙酰基]脲的分子特性及药物潜力
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月10日 来源:Results in Chemistry 2.5
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本研究通过DFT/B3LYP/6-311++G(d,p)理论计算,结合分子对接和分子动力学(MD)模拟,系统分析了BPCAU的分子结构、振动光谱、NLO性质及与GRK2受体的相互作用。结果表明其具有稳定的非平面构象和药物相似性,为开发新型心血管药物提供了理论依据。
在药物化学和材料科学领域,精确解析分子结构与功能的关系是设计新型化合物的关键。苯氧乙酸衍生物因其广泛的生物活性(如抗菌、抗肿瘤和调节植物生长)备受关注,但其分子层面的作用机制仍存在诸多未解之谜。特别是N-(正丁基)-N′-[(对氯苯氧基)乙酰基]脲(BPCAU)作为对氯苯氧乙酸的尿素衍生物,虽有潜在药用价值,却缺乏系统的理论研究和生物活性验证。
针对这一空白,研究人员采用多尺度计算方法展开研究。通过密度泛函理论(DFT)在B3LYP/6-311++G(d,p)水平上优化BPCAU的几何结构,发现其以C1对称性非平面构象存在,并形成O17-H23分子内氢键(键长1.959 ?)。振动光谱分析显示,102个振动模式与实验值吻合良好(均方根误差7.6 cm-1),其中氯苯氧基环的ν(C=C)8a和8b分别位于1600 cm-1和1585 cm-1,而尿素片段的ν(C=O)则在1700 cm-1呈现特征峰。非线性光学分析表明其超极化率βt仅为尿素的50%,排除了NLO应用可能。
前沿分子轨道分析揭示BPCAU的HOMO-LUMO能隙为5.50 eV,化学势μ=-3.993 eV,表明其具有适度反应活性。福井函数指出H35(Δf=-0.586)和C33(Δf=1.149)分别是亲电和亲核攻击的敏感位点。药物相似性评估显示其符合Lipinski规则(分子量284.74 g/mol,HBD=2,HBA=3),生物利用度评分0.55,且能穿透血脑屏障(BBB渗透值3.67)。
分子对接显示BPCAU与GRK2受体结合能达-5.23 kcal/mol,通过胺基与ASP335和ARG199形成氢键。50 ns分子动力学模拟证实复合物稳定性(RMSD 0.290 nm),PCA分析显示其协方差矩阵值(7.4376 nm)优于对照药物帕罗西汀。ADMET预测表明其具有低肝毒性(0.79)和致突变风险(0.80),但存在呼吸道毒性风险。
该研究发表于《Results in Chemistry》,首次通过理论计算阐明了BPCAU的构效关系,为其作为GRK2抑制剂治疗心血管疾病提供了分子基础。NBO分析揭示氮、氧孤对电子贡献312.24 kcal/mol稳定能,显著高于氯苯环的116.12 kcal/mol,这一发现为后续结构优化指明了方向。研究建立的DFT-MD联合策略也为同类化合物的虚拟筛选提供了可靠范式。
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