机器学习辅助蛋白质工程提升立体选择性的创新策略

【字体: 时间:2025年07月10日 来源:Chem Catalysis 11.5

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  【编辑推荐】针对酶天然底物特异性限制立体选择性的难题,研究人员通过机器学习辅助蛋白质工程,建立了基于实验数据的监督学习模型,成功预测并优化酶立体选择性(ee和E值)。该研究通过整合ΔΔG≠标准化数据和多模态算法,为高效可持续的不对称合成提供了新范式。

  

生物催化凭借温和的反应条件和卓越的选择性,已成为手性化合物合成的利器。然而,酶的立体选择性(stereoselectivity)常受限于天然底物特异性,这一瓶颈正被机器学习驱动的蛋白质工程突破。研究者通过分析生物催化反应数据,构建了能精准预测立体选择性的模型——将对映体过量值(enantiomeric excess, ee)和选择性因子(E值)统一转化为相对活化能差(ΔΔG),就像为酶分子装上了智能导航系统。

这项技术的核心在于三大创新:采用蛋白质语言模型与图结构嵌入的多模态算法,让预测跨越酶家族和底物壁垒;利用迁移学习减少实验室试错成本;通过可解释AI揭示关键残基作用机制。就像为酶分子绘制了立体选择性的"热力图",研究者甚至能反向设计出立体选择性反转的突变体。

尽管面临数据稀缺和模型泛化性等挑战,但融合高质量数据、精确的3D结构描述符和创新算法后,这套系统有望颠覆传统生物催化研发模式。未来,同步优化立体选择性、催化活性和酶稳定性的多目标优化策略,或将催生更绿色高效的手性药物合成生产线。

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