综述：编码序列中的m6A：连接沉积、翻译与衰变的调控机制

这篇综述深入探讨了mRNA内部最丰富的修饰——N6-甲基腺苷（m6A）在编码序列（CDS）中的动态调控作用，揭示了其通过外显子连接复合体（EJC）限制性沉积、触发翻译依赖性降解（CMD）的新机制，并阐明了该通路在癌症等疾病中的潜在治疗价值。文章创新性提出m6A的时空特异性调控网络，为RNA代谢研究提供了重要范式。

　　

m⁶A在RNA代谢中的核心地位

RNA生命周期从转录起始到降解终结，其动态周转过程受到m⁶A这一最丰富内部修饰的精密调控。作为表观转录组学的关键标记，m⁶A通过影响剪接、核输出及稳定性等环节塑造mRNA命运。特别值得注意的是，编码序列（CDS）区域的m⁶A修饰展现出独特的降解信号功能，其效率显著高于非翻译区（UTR）位点。

沉积调控：从染色质到剪接的多层次控制

m⁶A沉积遵循DRACH序列偏好性（D=A/G/U, R=A/G），由METTL3/METTL14甲基转移酶复合体催化完成。研究发现外显子连接复合体（EJC）通过空间位阻效应抑制剪接位点邻近区域的甲基化，形成特征性的m⁶A分布模式——主要富集于长内部外显子和终止密码子附近。这种"默认甲基化-局部抑制"模型通过深度学习预测得到验证：外显子-内含子边界特异性降低相邻外显子的m⁶A沉积。

6A沉积的多层次调控机制'>

沉积时相研究揭示m⁶A存在共转录与转录后双阶段修饰：初期低化学计量比均匀分布，后期经EJC引导形成成熟mRNA的特征模式。单分子测序技术dFORCE证实，剪接前的RNA已呈现外显子连接处m⁶A缺失，暗示除EJC外还存在其他调控因子。值得注意的是，RNA聚合酶II（RNAP II）延伸速度与m⁶A沉积效率呈负相关——减速的RNAP II使新生链二级结构减少，更易暴露甲基化位点。

CMD通路：连接翻译与降解的分子桥梁

CDS区域m⁶A触发的新型降解途径（CMD）展现出两大特征：

1. 严格翻译依赖性：翻译抑制剂可完全阻断CMD，且高翻译效率转录本降解更显著
2. 核糖体动力学改变：当m⁶A修饰密码子进入核糖体A位时，解码效率降低导致特征性暂停

结构生物学研究揭示，m⁶A的6-甲基基团可能干扰tRNA-mRNA配对，而tRNA修饰mcm⁵s²U可缓解这种效应。在癌症中该修饰的缺失会加剧核糖体碰撞，显著增强CMD活性。这种修饰间互作（m⁶A-mcm⁵s²U轴）为肿瘤特异性调控提供了新视角。

6A介导的多种衰变途径'>

加工小体：CMD的亚细胞枢纽

CMD靶标在加工小体（P-bodies）显著富集，这种相分离形成的无膜细胞器可能作为降解执行场所。研究观察到：

• CDS区m⁶A数量与P-body富集度正相关
• 关键脱帽酶DCP2在P-body共定位
• m⁶A缺失导致P-body数量减少

但P-body在CMD中究竟发挥主动降解还是临时存储功能，仍需进一步解析。单细胞研究显示其mRNA组成具有细胞周期依赖性，暗示m⁶A可能参与转录本时空特异性分配。

生理病理意义：从逆转录基因到癌症治疗

CMD通路选择性调控具有重要生理功能的基因：

• 逆转录基因质量控制：缺乏内含子的逆转录基因因失去EJC保护而m⁶A水平升高，导致快速降解
• 发育调控：SOX2、KLF4等发育关键因子受CMD精细调控
• 癌症关联：EP300、NOTCH1/2等癌相关转录本成为CMD靶标

METTL3抑制剂已进入AML临床I期试验（NCT05584111），而mcm⁵s²U缺失肿瘤对CMD的敏感性可能成为新的治疗突破口。值得注意的是，抑癌基因（如BRCA2）的同义突变可通过破坏m⁶A位点导致mRNA不稳定，揭示m⁶A在肿瘤发生中的双重角色。

未解之谜与未来方向

当前研究仍存在多个关键问题：

• m⁶A沉积与剪接的时序矛盾如何统一？
• 核糖体暂停如何精确转化为降解信号？
• P-body在CMD中是执行者还是"中转站"？
• 组织特异性调控机制是否存在？

这些问题的解答将推动m⁶A研究从机制解析向精准医疗转化，为癌症等疾病的治疗提供新策略。