基于图神经网络的TNBC活性化合物预测模型构建与机制解析

【字体: 时间:2025年07月11日 来源:Molecular Diversity 3.9

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  来自印度的研究人员针对三阴性乳腺癌(TNBC)治疗药物匮乏的难题,创新性地整合人工智能技术,构建了4种图神经网络模型(MPNN表现最优,AUC达0.82),通过756种突变型化合物数据集和十折交叉验证,成功识别出关键抑制片段,并经FDA药物验证取得97%预测准确率,为TNBC靶向药物开发提供新范式。

  

乳腺癌正以惊人速度席卷全球,其中三阴性乳腺癌(TNBC)因缺乏HER2/孕酮/雌激素受体表达而成为最难攻克的亚型。面对治疗选择有限的困境,科学家们另辟蹊径,从756个突变型化合物入手,在三种细胞系中训练出四大图神经网络模型——包括消息传递神经网络(MPNN)、图注意力网络等。这些模型经过严格的分层嵌套十折交叉验证,在Optuna框架调优下交出亮眼成绩单:预测AUC值稳定在0.65-0.82区间,其中MPNN模型更是拔得头筹。

研究团队还运用可解释性AI技术,像化学侦探般破解了分子结构与抑癌活性的密码,锁定关键药效团。更令人振奋的是,当模型遇到FDA批准药物库时,展现出66%-97%的惊人预测准确率,这些"数字药剂师"俨然成为筛选TNBC克星的智能雷达。这项研究不仅为抗癌药物研发装上AI引擎,更开辟了从分子图谱直通临床疗效的加速通道。

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