单双链DNA寡聚体中黄素-鸟嘌呤长寿命自由基对的直接观测及其生物磁感应机制研究

【字体: 时间:2025年07月11日 来源:Communications Chemistry 5.9

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  本研究通过时间分辨电子顺磁共振(TREPR)光谱技术,首次在黄素修饰的单双链DNA寡聚体中直接观测到微秒级长寿命的自旋相关自由基对([Fl•-...G•+]),揭示了不同于隐花色素蛋白的三态前驱体反应路径。该发现为理解DNA电荷转移机制及生物磁感应提供了新视角,对开发磁场响应型生物材料具有重要启示。

  

自然界中许多生物能够感知微弱的地磁场(约50μT),这种能力被认为与隐花色素蛋白中光诱导产生的自旋相关自由基对(SCRP)有关。然而,DNA作为遗传物质载体,其电荷转移机制与蛋白质存在显著差异——蛋白质中电子转移(ET)通过多步量子隧穿进行,而DNA则可能通过单步隧穿、鸟嘌呤(G)跳跃或极化子传输等多种机制实现。这种差异引发了关键科学问题:DNA能否像蛋白质一样形成长寿命SCRP?这种机制是否参与生物磁感应?

日本分子科学研究所(Institute for Molecular Science, Japan)的Yoshimi Oka团队设计了一系列黄素(Fl)修饰的DNA寡聚体(见表1),通过时间分辨电子顺磁共振(TREPR)和瞬态吸收(TA)光谱,首次在单双链DNA中观测到寿命达4.3-13.6微秒的[Fl•-...G•+]自由基对。研究发现,与隐花色素中通过单态前驱体生成SCRP不同,DNA体系中自由基对主要来源于黄素三重态,且在28 mT磁场下表现出高达65%的磁场效应(MFE),这比已报道的隐花色素效应强3-6倍。该成果发表于《Communications Chemistry》,为生物磁感应机制提供了全新分子模型,并可能解释光解酶修复DNA损伤过程中的磁场敏感性。

研究采用三大关键技术:1)黄素修饰的DNA寡聚体化学合成(通过氨基修饰剂连接C3/C6 linker);2)时间分辨电子顺磁共振(TREPR)检测自由基对动态(X波段,5°C);3)瞬态吸收光谱(TA)结合磁场效应分析(532 nm探测光,28 mT扫描)。所有样本在10 mM磷酸缓冲液(pH 7.0)中制备,浓度统一为50μM。

设计合成与热稳定性验证
通过差示扫描量热法(DSC)证实,四重G→I替换使DNA熔解温度(Tm)降低11.9 K,但所有寡聚体在实验温度(5°C)下保持稳定结构。荧光淬灭实验显示,鸟嘌呤(G)的电子供给能力显著强于腺嘌呤(A),而互补链引入色氨酸类似物吲哚(Indole)后淬灭效率达91%,印证其更低氧化电位(0.78 V vs SCE)。

自由基对的直接观测
TREPR谱图(图2a)显示ss-Fl-DNA(G4)在1.5μs时出现E/A极化模式(g=2.0035),模拟计算证实其为[Fl•-...G•+]自由基对。关键对照实验表明:1)G(3)位点是电子转移必需位点(ss-Fl-DNA(I1G3)无信号,图2b);2)G多聚体非必需(ss-Fl-DNA(G1I3)仍可形成自由基对,图3a);3)低温(-123°C)冻结ET过程(图3b),提示液相中扩散控制机制。

双链结构与抑制效应
ds-Fl-DNA(G4)/N-DNA中自由基对寿命延长至13.6μs(图4a),对应 donor-acceptor距离约21?。通过点偶极近似计算,偶极耦合DRP为-0.48 mT。而互补链引入吲哚(ds-Fl-DNA(G4)/Ind-DNA)完全抑制自由基对生成(图4c),证实低电位电子供体的竞争机制。

三重态前驱体与磁场效应
TA光谱(图5)揭示ss-Fl-DNA(G4)的慢衰减组分(0.2-1μs)存在显著正MFE,谱宽达12 mT(半峰宽),表明三重态前驱体通过自旋弛豫主导自由基对生成。该效应在G→I替换样本(ss-Fl-DNA(I4))中消失,验证了G的特异性作用。

这项研究突破性地证实:1)DNA可通过不同于蛋白质的三重态路径形成长寿命SCRP;2)黄素-鸟嘌呤自由基对在室温下具有显著磁场敏感性;3)DNA构象(如单/双链、G排列)可调控自由基对寿命。这些发现不仅拓展了生物磁感应机制的认识,还为开发基于DNA的磁场响应材料(如靶向药物递送系统)提供了理论依据。未来研究可进一步探索DNA构象-磁场敏感性关联,以及该机制在光解酶修复UV损伤DNA中的作用。

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