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综述:邻近标记技术架起分子与细胞神经科学研究的桥梁
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月11日 来源:Experimental & Molecular Medicine 9.5
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这篇综述系统阐述了邻近标记(PL)技术在神经科学研究中的革命性应用,从基础工具BioID/APEX到创新技术TurboID/光激活系统,揭示了神经环路中动态蛋白互作网络。通过整合多组学策略和先进成像技术,PL为解析突触重塑、钙信号传导及神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)的分子机制提供了全新框架,是连接分子与细胞神经科学的"桥梁技术"。
邻近标记(PL)技术通过将工程化酶与目标蛋白(POI)融合,在活细胞或活体动物中催化生物素共价标记邻近蛋白,突破了传统免疫沉淀技术的局限。从最初的BioID(利用大肠杆菌突变生物素连接酶BirA)到优化版BioID2,标记半径约10nm的局限性逐渐被克服。APEX系统通过氧化生物素酚在过氧化氢存在下实现分钟级标记,其升级版APEX2进一步降低细胞毒性。TurboID及其分裂版本Split-TurboID通过定向进化获得超强催化活性,能捕捉快速动态的蛋白互作,特别适用于神经元突触毫秒级信号事件的研究。

在抑制性突触研究中,Uezu等通过病毒递送gephyrin-BirA融合蛋白,首次鉴定出181个抑制性突触后密度(iPSD)蛋白,包括调控GABA能抑制的新蛋白InSyn1。Spence团队则用Wrp-BirA标记树突丝状伪足,发现肌动蛋白调节因子CARMIL3对AMPA受体(AMPAR)突触定位的关键作用。
针对帕金森病相关的中脑多巴胺能(mDA)神经元,Hobson采用APEX2技术揭示纹状体轴突富含代谢和神经传递相关蛋白,为神经退行性病变机制研究提供新视角。在自闭症(ASD)研究领域,Murtaza通过BioID2绘制41个ASD风险基因的PPI网络,发现线粒体功能与突触传递的共同通路异常。
Dumrongprechachan开发的Cre依赖性APEX2报告小鼠,可在1小时内完成谷氨酸能/GABA能神经元的特异性标记。Sun团队通过AAV递送TurboID,获得约10,000个神经元/星形胶质细胞特异性蛋白。Kumar则发现阿尔茨海默病早期,小清蛋白(PV)中间神经元已出现线粒体功能障碍和突触蛋白丢失。

光催化PL技术如PhoTag利用450nm蓝光激活黄素催化剂,实现酪氨酸残基的特异性标记。钙激活Split-TurboID(CaST)通过钙调素-M13肽段重组记录神经元活动,在自由活动动物中捕获钙信号依赖的蛋白互作。抗体识别生物素化(BAR)技术则突破遗传操作限制,在固定人脑组织中发现α-突触核蛋白病理网络。
磷酸化蛋白质组学方面,pAPEX和SubMAPP技术结合PL与磷酸化富集,揭示MAPK1/PKA激酶底物的时空动态。多组学整合方面,FucoID通过岩藻糖基转移酶标记肿瘤浸润淋巴细胞,结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)解析免疫-肿瘤互作图谱。
当前PL技术仍面临内源性生物素化蛋白干扰、标记时空分辨率有限等挑战。通过肽段级富集直接鉴定生物素化位点,或基因敲除羧化酶可降低背景噪音。未来,整合超分辨率PL(SR-PL)与冷冻电镜等技术,将推动神经环路分子架构研究进入原子尺度,为神经精神疾病治疗靶点发现提供全新范式。
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