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circATXN1调控缺血性疾病中部分内皮-间质转化的分子机制及治疗潜力
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月11日 来源:Nature Communications 14.7
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本研究针对缺血性疾病中血管再生障碍的关键问题,揭示了环状RNA circATXN1通过ALKBH5介导的SLUG mRNA m6A去甲基化调控部分内皮-间质转化(partial EndMT)的新机制。研究人员通过多组学分析和功能实验证实,抑制circATXN1可促进血管新生并改善缺血组织修复,为缺血性疾病提供了新的治疗靶点。
在心血管疾病领域,缺血性损伤导致的血管再生障碍一直是临床治疗的难点。尽管内皮细胞(ECs)具有通过内皮-间质转化(EndMT)获得迁移能力促进血管新生的潜力,但调控这一动态过程的分子机制尚不明确。尤其令人困惑的是,完全EndMT会导致内皮特性丧失,而部分EndMT却能保留部分内皮特征并促进血管再生——这种"半转化"状态如何被精确调控?
郑州大学第一附属医院的研究团队在《Nature Communications》发表的研究给出了答案。通过高通量测序,研究人员发现环状RNA circATXN1在缺氧诱导的部分EndMT中显著上调。进一步实验揭示,circATXN1通过结合去甲基化酶ALKBH5,阻止其入核发挥m6A去甲基化功能,从而降低关键转录因子SLUG的mRNA稳定性。这种调控机制直接影响内皮细胞的增殖、迁移和成管能力,最终决定血管再生效率。
研究团队运用了多项关键技术:建立心肌梗死(MI)和下肢缺血(HLI)小鼠模型模拟人类疾病;通过单细胞转录组分析揭示部分EndMT特征;采用RNA-pulldown结合质谱鉴定circATXN1互作蛋白;利用m6A甲基化检测(MeRIP-qPCR)和核质分离实验解析ALKBH5的时空调控机制;开发AAV9载体实现内皮特异性基因干预。
circATXN1在部分EndMT内皮细胞中上调
缺氧处理的人心脏微血管内皮细胞(HCMECs)显示CD31表达下降而αSMA表达上升的"半间质化"特征,circRNA测序鉴定出circATXN1显著上调。临床样本分析证实,心肌梗死患者外周血外泌体中circATXN1水平升高,提示其作为生物标志物的潜力。
缺氧诱导的circATXN1特征
circATXN1源自ATXN1基因第7外显子,长2078nt,RNase R抗性证实其环状结构。RNA-FISH显示其定位于胞质,且表达受剪接因子QKI调控,与宿主基因转录无关。
circATXN1抑制缺氧诱导的部分EndMT
敲低circATXN1增强HCMECs在缺氧下的增殖(FUCCI检测显示S/G2-M期细胞增加)、迁移(Transwell实验)和成管能力(Matrigel实验),同时上调间质标志物(fibronectin/αSMA)并下调内皮标志物(VE-cadherin/CD31)。过表达则呈现相反表型,证实其对EndMT程度的调控作用。
circATXN1敲低增强体内部分EndMT
内皮特异性敲低circATXN1的AAV9处理显著改善MI小鼠心功能(超声显示LVEF提高)和HLI模型血流恢复(激光多普勒检测),同时增加CD31+/αSMA+双阳性细胞。值得注意的是,高剂量AAV(8×1011 VG)引发肝毒性,提示治疗窗需精确控制。
circATXN1通过抑制SLUG调控部分EndMT
在六种EndMT相关转录因子中,仅SLUG蛋白水平与circATXN1负相关。挽救实验证实SLUG敲除可逆转circATXN1缺失引起的促迁移效应,但双荧光素酶报告基因显示circATXN1不直接调控SLUG启动子活性,排除了转录水平调控的可能性。
circATXN1与ALKBH5相互作用
RNA-pulldown联合质谱鉴定出m6A去甲基化酶ALKBH5是circATXN1的结合蛋白。免疫共沉淀(Co-IP)验证两者直接互作,且ALKBH5内皮特异性敲除(ALKBH5CKO)小鼠中,circATXN1的促血管效应完全消失。
circATXN1通过阻止ALKBH5核转位降低SLUG稳定性
机制研究表明,circATXN1通过增强ALKBH5与核输出蛋白CRM1的结合,抑制EGFR介导的ALKBH5磷酸化,从而阻止其入核。ALKBH5在核内结合pre-SLUG mRNA(AlphaFold2预测显示其与pre-mRNA结合位点比成熟mRNA多3倍),通过去m6A修饰维持RNA稳定性——这一发现首次揭示了环状RNA通过调控pre-mRNA加工影响细胞命运的路径。
这项研究不仅阐明了circATXN1/ALKBH5/SLUG轴在缺血性疾病中的关键作用,更提出了"部分EndMT"的精确调控范式:适度的SLUG表达使内皮细胞获得迁移能力而不完全丧失原有特性,这种平衡对血管再生至关重要。研究还开发了基于AAV的circATXN1靶向治疗策略,为缺血性疾病提供了从诊断到治疗的全新思路。值得注意的是,circATXN1在胃癌中通过miR-526b-3p/MMP2通路促血管生成,而在心血管中通过ALKBH5非依赖miRNA的机制发挥作用,这种"环境依赖性功能切换"为RNA治疗的精准设计提供了重要参考。
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