急性肾损伤中PANoptosis的整合多维分析:关键生物标志物的发现与机制研究

【字体: 时间:2025年07月12日 来源:Journal of Inflammation Research 4.2

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  这篇研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和转录组数据,结合机器学习算法,揭示了PANoptosis(一种整合凋亡、焦亡和坏死性凋亡的程序性炎症细胞死亡)在急性肾损伤(AKI)中的关键作用。研究鉴定出EGR1、CEBPD、HSPA1A、HSPA1B和RHOB五个核心基因,其诊断效能(AUC>0.9)和功能富集分析表明其与PANoptosis显著相关,为AKI的临床评估和靶向治疗提供了新思路。

  

单细胞转录组图谱与细胞分型

研究通过分析32例肾脏组织的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据(正常20例,AKI 12例),消除批次效应后,将25,684个细胞聚类为14种类型。AKI组织中近端小管(PT)细胞、髓袢(LOH)细胞和巨噬细胞(MC)比例显著升高,而远端小管(DT)细胞和内皮细胞(EC)减少。功能富集显示,PT细胞标志基因与毒素反应相关,提示其在AKI中的核心作用。

PANoptosis相关基因的鉴定

通过AUCell等算法评估凋亡、焦亡和坏死性凋亡活性,发现AKI组织中三者均显著上调。差异表达分析筛选出48个PANoptosis相关基因(35个上调,13个下调),其中凋亡活性在集合管细胞(IC)中最高,焦亡和坏死性凋亡则在单核细胞(MON)和MC中富集。这一发现突破了传统PT细胞死亡的局限,揭示了IC和免疫细胞在AKI中的潜在作用。

机器学习筛选关键基因

结合七种算法(如随机森林、LASSO)从候选基因中锁定五个核心基因:EGR1、CEBPD、HSPA1A、HSPA1B和RHOB。这些基因在AKI中表达显著升高,诊断曲线下面积(AUC)均超过0.9,其中EGR1的AUC达0.981。基因集富集分析(GSEA)证实它们与PANoptosis通路高度相关。

动物模型验证

通过缺血再灌注损伤(IRI)构建AKI小鼠模型,Western blot和免疫组化(IHC)显示核心基因在肾组织中表达增加,且与肾小管损伤评分呈正相关。例如,CEBPD在IC和MC中核定位,而HSPA1A/B在胞质高表达,提示其参与细胞应激和死亡调控。

讨论与展望

研究首次系统解析了PANoptosis在AKI中的异质性,并明确了跨细胞类型的调控网络。EGR1可能通过MAPK/ERK通路促进纤维化,而HSPA1A/B和RHOB的分子机制仍需深入探索。尽管缺乏临床样本验证,但多组学整合与机器学习的方法为AKI的精准诊疗提供了新策略。未来需进一步探究这些基因如何协同调控PANoptosome复合体的组装,以及其在其他肾病中的普适性。

(注:全文基于原文数据缩编,未添加非原文结论)

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