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两种陆生等足目动物(普通卷甲虫与暗球鼠妇)真菌组比较分析揭示宿主特异性驱动微生物群落组装
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月12日 来源:Mycobiology 1.6
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本研究通过ITS区域高通量测序(metabarcoding)首次系统比较了韩国岛屿生境中两种陆生等足目动物(Armadillidium vulgare与Spherillo obscurus)的真菌群落结构。研究发现S. obscurus携带显著更丰富的真菌多样性(252 OTUs中仅27个共享),其群落包含子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和被孢霉门(Mortierellomycota)等多类群,而A. vulgare则被球腔菌属(Mycosphaerella)绝对主导(相对丰度88.6–94.0%)。α/β多样性分析表明宿主身份(R2=0.496)而非地理因素主导群落差异,LEfSe分析进一步揭示宿主特化菌群。该研究为土壤无脊椎动物-真菌互作机制提供了新见解。
陆生等足目动物作为土壤生态系统关键分解者,其共生微生物群落对宿主生态功能具有重要贡献。尽管前人研究揭示了等足目动物与细菌的互作关系,但其真菌群落(mycobiome)的组成规律仍不清楚。本研究聚焦韩国岛屿生境中同域分布的两种等足目动物——广泛分布的普通卷甲虫(Armadillidium vulgare)和地方性物种暗球鼠妇(Spherillo obscurus),通过ITS区域高通量测序技术,首次系统比较了两者的真菌群落差异。
研究团队于2024年4-5月在韩国黑山岛和渔青岛采集16个个体(每种8个),采用70%乙醇表面灭菌后提取全基因组DNA。通过两轮PCR扩增ITS区域(引物:ITS1Fngs/ITS4→ITS1Fngs/ITS2ngs),利用Illumina MiSeq平台测序。生物信息学分析采用QIIME2流程,经DADA2去噪后以97%相似度聚类OTUs,基于UNITE数据库进行物种注释。统计分析包括α多样性(Shannon指数、Pielou均匀度)、β多样性(Bray-Curtis距离+NMDS可视化)以及LEfSe差异菌群鉴定。
测序共获得1,119,803条高质量序列,鉴定出252个OTUs,涵盖9门134属。核心发现包括:
多样性差异:S. obscurus携带206个OTUs(显著高于A. vulgare的73个),仅27个OTUs为两宿主共享,包括枝孢菌(Cladosporium)、曲霉(Aspergillus)等广布类群。
群落结构:A. vulgare真菌群落高度单一,96.5–100%为子囊菌门,其中球腔菌目(Mycosphaerellales)占比88.6–94.0%;而S. obscurus呈现多门类共存,子囊菌门(21.9–46.8%)、担子菌门(2.0–30.5%)和被孢霉门(0.3–18.1%)构成三足鼎立格局。
宿主特化信号:LEfSe分析显示S. obscurus显著富集肉座菌目(Hypocreales)、炭疽菌属(Colletotrichum)等类群,而A. vulgare特异性关联球腔菌属。PERMANOVA证实宿主身份解释49.6%的群落变异(p=0.001),显著强于地理因素(R2=0.039, p=0.811)。
本研究揭示了等足目动物真菌群落的三大生态规律:
宿主过滤效应:A. vulgare的干燥微生境偏好可能通过物理过滤(如低湿度耐受性)选择出以球腔菌属为核心的耐旱菌群,而S. obscurus的腐木生境为多类真菌提供了生态位。
功能互补假说:S. obscurus富集的炭疽菌属(植物病原/内生菌)、Bjerkandera(木质素降解菌)等提示其可能通过食物链获取环境菌群,而A. vulgare的单一菌群可能反映其特化的营养代谢途径。
岛屿生物地理学启示:尽管采样于隔离岛屿,地理距离未显著影响菌群组成,暗示宿主内在因素(如免疫识别、肠道pH)在微生物筛选中起主导作用。
当前研究受限于样本量(n=16)和季节因素(春季采样可能偏好耐旱菌群)。未来需开展跨季节采样和功能实验(如菌群移植)以验证宿主-菌群互作机制。该成果为理解土壤动物-微生物共生系统的组装规则提供了新范式。
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