硼酸修饰核苷的固态合成与结构表征:一种新型胸苷类似物的开发与应用前景

【字体: 时间:2025年07月12日 来源:Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids 1.1

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  这篇综述系统阐述了硼酸修饰核苷(Boronic acid-modified nucleoside)的合成策略与固态结构特征,首次通过单晶X射线衍射(SC-XRD)解析了未保护硼酸核苷的三维构象,并与TBS保护衍生物进行对比。研究揭示了硼酸基团对核苷糖环折叠(sugar pucker)和碱基几何构型的微小影响,证实其通过分子间氢键形成线性锯齿链超结构(zigzag suprastructure),为开发基于硼酸功能化寡核苷酸(Boro-ONs)的核酸药物提供了结构基础。

  

硼酸修饰核苷的结构突破与治疗潜力

摘要

研究团队首次成功解析了未保护硼酸修饰核苷的固态结构,通过单晶X射线衍射(SC-XRD)揭示了其独特的分子构象。与天然核苷相比,该修饰核苷仅表现出轻微的糖环折叠(C3'-endo构型)差异,而碱基几何构型保持高度保守。分子间氢键网络驱动形成线性锯齿链超结构,为开发新型功能化核酸药物奠定基础。

引言

含硼药物因其独特的sp2/sp3杂化转换能力和强路易斯酸性,在蛋白酶体抑制剂(如硼替佐米Velcade?)等领域大放异彩。核酸药物面临稳定性差、细胞摄取率低等挑战,化学修饰成为突破方向。硼酸修饰可通过可逆结合细胞表面糖链增强递送效率,但此前缺乏完整的结构生物学证据。

结果与讨论

合成创新
研究优化了Kavoosi报告的合成路线:

  • 金属-卤素交换法在5-溴-2'-脱氧尿苷引入硼酸基团
  • 采用MIDA硼酸酯保护策略(收率37%)
  • 以TBAF替代HF•pyridine脱除TBS保护基(收率提升至86%)

固态结构特征
未保护核苷

  • 糖环呈现非典型北式构象(P=32.3°,νmax=28.6°)
  • 硼酸羟基与碱基O5形成分子内氢键(d=2.724 ?)
  • 通过N2-H···O2'等八重氢键构建三维网络

TBS保护衍生物2

  • 空间位阻导致糖环转为南式构象(C2'-endo)
  • 分子间氢键减少,形成平行锯齿链

生物医学意义

  • 硼酸修饰保持天然核苷的anti构象(χ=-109.7°),兼容DNA双螺旋
  • pKa测定显示硼酸显著影响尿嘧啶解离特性(pKa1=5.8)
  • 为开发靶向糖链的核酸递送系统提供结构模板

结论

该研究不仅填补了硼酸修饰核苷结构生物学的空白,更通过优化的合成路线(反应时间缩短50%)推动其实际应用。结构数据证实硼酸修饰对核苷整体构象干扰极小,支持其作为胸苷类似物整合入治疗性寡核苷酸,在硼中子俘获治疗(BNCT)和抗HIV-1药物开发中展现独特价值。

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