综述：反义长链非编码RNA的隐藏力量：探索双链RNA形成介导的新调控层

这篇综述深入探讨了反义长链非编码RNA（asRNA）通过形成双链RNA（dsRNA）调控基因表达的新机制，重点以缺失RNA干扰（RNAi）系统的酿酒酵母（S. cerevisiae）为模型，揭示了asRNA通过促进核输出增强基因表达的普遍功能，为理解lncRNA在疾病和进化中的角色提供了新视角。

　　

ABSTRACT

过去十年间，非编码RNA（ncRNA）因其在细胞中的广泛存在和功能复杂性成为研究热点。尽管最初被视为“垃圾RNA”，长链非编码RNA（lncRNA）现已被确认为细胞内的关键调控因子，并与疾病密切相关。其中，反义RNA（asRNA）作为lncRNA的最大亚类，在酿酒酵母中被发现具有普遍功能。由于酵母缺乏RNAi系统，研究者能够无偏地探索asRNA通过形成双链RNA（dsRNA）调控基因表达的机制。

合成与基因组定位

真核基因组中存在广泛的转录活动，称为“普遍转录”。lncRNA可源自基因间区域（lincRNA）、正义链或反义链（asRNA），后者占人类基因的60%。asRNA与mRNA的配对形成dsRNA，可能成为RNAi的靶标，但在酵母中，这种配对反而通过增强核输出提升基因表达。

酵母中lncRNA的分类

酿酒酵母中的lncRNA根据稳定性分为：稳定未注释转录本（SUT）、隐蔽不稳定转录本（CUT）、Nrd1敏感转录本（NUT）等。XUTs（Xrn1敏感转录本）多为asRNA，能形成dsRNA结构。研究表明，dsRNA的形成依赖解旋酶Dbp2，其缺失导致细胞应激耐受性下降。

核内功能

asRNA可通过转录干扰或染色质修饰（如组蛋白去乙酰化酶HDAC招募）抑制基因表达。但最新研究发现，asRNA与mRNA形成的dsRNA能优先结合核输出受体Mex67-Mtr2，加速核质转运，从而提升翻译效率。这一机制在应激条件下尤为关键，帮助细胞快速适应环境变化。

细胞质功能

XUTs和SUTs被发现与多核糖体结合，部分asRNA携带小开放阅读框（smORF），可能通过无义介导的降解（NMD）被清除。dsRNA在核输出中的优势解释了为何共表达asRNA的mRNA胞质比例更高，最终导致蛋白质产量增加。

asRNA在人类中的潜在作用

尽管高等生物存在RNAi和免疫识别dsRNA的屏障，但天然反义转录本（NAT）仍可能通过类似机制调控基因表达。例如，SINEUP类asRNA通过5'UTR配对促进核糖体结合，而MIR-NATs则干扰翻译。组织特异性表达模式暗示asRNA在发育和疾病中具有精细调控功能。

未来展望

asRNA介导的基因表达增强机制为理解lncRNA的进化意义和疾病关联提供了新框架。后续研究需解析dsRNA的结构特征、结合蛋白及其在高等生物中的保守性，为相关治疗策略开发奠定基础。