跨人群GWAS与蛋白质组学联合分析提升房颤风险预测并揭示其分子机制

【字体: 时间:2025年07月12日 来源:Nature Communications 14.7

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  研究人员针对房颤(AF)遗传机制不清、风险预测精度不足等问题,开展了跨人群全基因组关联研究(GWAS)与蛋白质组学整合分析。通过对168,007例AF患者的多族群meta分析,新发现379个风险位点,鉴定出PITX2和ZFHX3等跨人群共享基因,揭示肌肉收缩、TGF-β通路等关键机制,并通过孟德尔随机化(MR)锁定28个潜在治疗靶点。研究构建的多组学风险预测模型将AUC提升至0.823,为房颤精准防治提供新策略。

  

房颤作为全球最常见的心律失常,影响着近6000万人的健康,其发病率随人口老龄化持续攀升。尽管已知遗传因素贡献显著,但现有研究多基于欧洲人群,导致非欧族群风险位点检出不足,且分子机制与精准预测体系亟待完善。更棘手的是,房颤与肥胖、高血压等代谢疾病存在复杂关联,但因果方向不清;而临床常用的NT-proBNP等生物标志物与疾病的因果关系也存在争议。这些知识缺口严重制约了房颤的早期干预和靶向治疗开发。

针对这些挑战,美国宾夕法尼亚大学(University of Pennsylvania)Perelman医学院的Shuai Yuan、Scott M. Damrauer团队与瑞典卡罗林斯卡学院的Susanna C. Larsson团队联合开展了一项里程碑式研究。他们整合了来自欧洲、东亚、非洲等五大族群超过200万人的数据,通过创新性的多组学整合分析策略,不仅大幅扩展了对房颤遗传架构的认知,更建立了迄今最精准的风险预测模型。这项突破性成果近期发表于《Nature Communications》。

研究团队运用三大核心技术:1)跨人群GWAS meta分析(含168,007病例)结合连锁不平衡评分回归(LDSC)评估遗传贡献;2)采用孟德尔随机化(MR)和共定位分析(colocalization)解析风险因素与蛋白质的因果关联;3)基于LASSO回归构建蛋白质评分(ProS),并与多族群多基因风险评分(PGS)整合优化预测模型。队列数据涵盖英国生物银行(UK Biobank)、百万退伍军人计划(MVP)等9大研究平台。

跨人群GWAS meta分析发现525个风险位点

通过整合欧洲(153,980例)、东亚等五大族群数据,研究鉴定出525个全基因组显著位点(P<5×10-8),其中379个为首次报道。值得注意的是,SORCS3、POLD1等6个位点效应值(OR>1.3)显著高于平均水平,而PITX2和ZFHX3是唯二跨所有族群共享的基因位点。

多维度基因优先排序揭示核心通路

通过MAGMA、PoPS等6种方法对504个位点进行基因注释,发现70个基因携带蛋白编码变异。Reactome数据库分析显示,肌肉收缩(P=3.2×10-15)和心脏发生通路显著富集;GO分析则进一步锁定TGF-β响应、电耦合调控等新机制。

族群特异性遗传相关性分析

欧洲人群显示AF与95种循环系统疾病显著相关,而非洲人群仅18种。异质性分析发现房室传导阻滞、深静脉血栓等7种表型存在显著族群差异(I2>75%),提示不同人群需定制化防治策略。

孟德尔随机化锁定28个治疗靶点

通过蛋白全基因组MR分析2847个蛋白质,发现ING1(OR=0.61)和ATXN2L(OR=1.68)等28个蛋白与AF存在因果关联,其中ICAM1、ANGPT1等7个靶点已有对应药物进入临床。反向MR显示AF遗传风险会降低NT-proBNP水平(β=-0.18),颠覆了传统生物标志物认知。

多组学模型实现精准预测

在宾夕法尼亚医学生物银行(PMBB)验证中,新型PGS的AUC达0.780,显著优于既往模型(P<2.2×10-16)。当联合95个蛋白质标志物构建的ProS后,预测效能进一步提升至AUC=0.823,使最高风险组别人群的AF发生风险提升6.38倍。

这项研究通过前所未有的跨族群、多组学整合分析,系统揭示了房颤的遗传基础和分子机制,其创新性主要体现在三方面:首先,发现PITX2等关键基因的跨人群保守性,为靶向药物开发提供新方向;其次,破解了NT-proBNP与AF的复杂因果关系,纠正了临床标志物认知偏差;最后,构建的多组学预测模型将风险识别精度推向新高度,为个性化预防提供工具。值得注意的是,研究中发现的TGF-β通路异常、血管重塑等新机制,为研发抗纤维化疗法开辟了道路。尽管当前蛋白质靶向药物尚未获批用于房颤治疗,但ANGPT1等已有临床阶段药物的靶点,有望通过"老药新用"策略加速转化应用。

该研究的局限在于非欧族群样本量相对不足,可能遗漏部分族群特异性位点;此外,部分蛋白质关联在芬兰队列中未能重复,提示需进一步验证。未来研究应扩大非洲、拉美等代表性不足人群的样本规模,并通过类器官模型等功能实验验证候选靶点。总体而言,这项工作通过遗传学与蛋白质组的"双镜"聚焦,为理解房颤病因学树立了新范式,其方法论框架也可拓展至其他复杂疾病研究。

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