中国东北农村地区结核病近期传播的高比例：基于兴安盟3年前瞻性群体基因与空间分析

本研究通过全基因组测序(WGS)技术对内蒙古兴安盟(HL)结核病(MTB)传播动态进行分子流行病学分析，揭示该地区近期传播率高达48.1%，显著高于中国其他农村地区（31.4%）。研究发现L2谱系北京家族菌株(89%)呈现更短终端分支长度和更高传播效率，空间分析锁定扎赉特旗(JB)为传播热点，为精准防控提供科学依据。

　　

ABSTRACT
结核病(TB)仍是中国的重大公共卫生挑战。内蒙古兴安盟(HL)作为结核病高负担地区，其传播模式长期缺乏系统研究。2021-2023年前瞻性研究对221株结核分枝杆菌(MTB)进行全基因组测序(WGS)，最终纳入210例分析。基因组聚类率揭示近期传播水平，逻辑回归识别风险因素，核密度估计完成空间分析。

INTRODUCTION
结核病由MTB引起，2022年成为仅次于COVID-19的致命性传染病。中国年新增74.8万病例，但农村低密度人口区传播动态研究匮乏。HL作为内蒙古东北部结核病发病率最高地区（55,130 km²，人口密度29/km²），亟需阐明其传播特征。

MATERIALS AND METHODS
研究纳入HL六行政区痰涂片阳性病例。采用UKMYC6板进行13种抗结核药物敏感性检测(DST)，Illumina Hiseq X10平台完成WGS。通过TB-Profiler v5.0.1鉴定菌株谱系和耐药突变，IQ-Tree v2.2.2构建最大似然系统发育树。应用百度地图API进行病例空间定位，R语言完成核密度分析与统计学检验。

RESULTS
主要发现包括：

1. 菌株特征：89%（187/210）为L2.2.1亚系（北京家族），L4菌株仅占11%。L2菌株终端分支长度显著短于L4（P<0.001），显示更强传播性。
2. 耐药谱：总体耐药率21.9%，发现6例耐多药结核(MDR-TB)和5例准广泛耐药结核(pre-XDR-TB)。
3. 传播动态：48.1%病例（101/210）属于≤10 SNP的基因组簇，最大簇C1含26株菌。扎赉特旗(JB)患者聚类风险显著增高（OR=14.88，P<0.001）。
4. 空间分布：病例集中分布于HL东部，JB城区既是疫情热点也是近期传播核心区。簇内病例中位距离达49公里，仅28.7%居住在2公里范围内。
5. 时间趋势：诊断率呈现上半年高峰的季节性波动，2022年聚类病例密度异常升高。

DISCUSSION
研究首次揭示HL地区结核病传播的三大特征：

1. 北京家族菌株主导的活跃传播：L2菌株较短的分支长度和较高聚类比例（50.8% vs L4的26.1%）提示其适应性优势。
2. 耐药产生机制差异：仅19.6%耐药病例位于传播簇，支持耐药主要源于患者体内de novo进化而非传播的假说。
3. 城乡传播模式分化：JB农村地区以近期传播为主，而乌兰浩特市(UC)等城市区域更可能为潜伏感染再激活。

IMPORTANCE
该研究为农村结核病防控提供关键启示：

1. 需针对传播热点实施差异化策略，JB等重点区域应强化传染源发现和传播链阻断。
2. 耐药监测应关注治疗过程中获得性耐药，尤其对L2菌株感染者。
3. 时空分析技术可有效识别潜在暴发事件，如2022年聚类病例激增需追溯社会因素。

ACKNOWLEDGMENTS
感谢当地医务人员在数据采集中的贡献。研究受国家重点研发计划（2022YFC2305204）等资助，所有作者均参与论文撰写与修订。