德国汉堡污水中分离的5株鲍曼不动杆菌噬菌体全基因组特征及比较分析

来自加拿大的研究人员从德国汉堡污水中分离出5株鲍曼不动杆菌噬菌体（Bhz9/15/16/20/21），完成全基因组测序（41,054-167,277 bp）及功能注释。研究发现这些噬菌体涵盖肌尾（myovirus）、长尾（siphovirus）和短尾（podovirus）三种形态型，其中Bhz15携带6个tRNA基因，为噬菌体疗法应对多重耐药鲍曼不动杆菌感染提供了新的生物资源。

　　

在德国汉堡-埃彭多夫污水处理厂（坐标：53.59001723110464, 9.978468493378452）的1升污水样本中，科研人员通过0.45微米滤膜过滤后，采用双层琼脂法成功分离出五株鲍曼不动杆菌（Acinetobacter baumannii）噬菌体。透射电镜观察显示这些噬菌体呈现三种典型形态：长尾噬菌体（siphovirus）Bhz9/Bhz20、短尾噬菌体（podovirus）Bhz16/Bhz21以及肌尾噬菌体（myovirus）Bhz15。

基因组测序揭示其双链DNA长度从41,054 bp到167,277 bp不等，GC含量介于36.4%-48.9%。值得注意的是，仅Bhz15携带6个tRNA基因，可能通过补偿宿主tRNA不足或平衡GC含量差异来提升感染效率。通过Illumina NextSeq 2000平台（2×151 bp）测序，结合SPAdes和Ray软件组装，获得50-214倍覆盖深度的完整基因组。

比较基因组分析显示：

• 短尾噬菌体Bhz16/Bhz21属于Friunavirus属，与APK37.1噬菌体存在89%核苷酸相似性

• 长尾噬菌体Bhz9/Bhz20与DMU1噬菌体相似度达97%，基因组中检测到整合酶基因暗示其温和噬菌体特性

• 巨型肌尾噬菌体Bhz15与Straboviridae科的Melin噬菌体具有96%相似性，含267个预测开放阅读框（orfs）

这些噬菌体已保藏于德国DSMZ菌种库和加拿大拉瓦尔大学噬菌体参考中心，为应对临床多重耐药鲍曼不动杆菌感染提供了新的生物武器库。研究获得加拿大国家研究委员会创新基金和多伦多大学噬菌体加速基金支持。