多组学遗传学解析颅内动脉瘤潜在分子靶点:从孟德尔随机化到药物重定位

【字体: 时间:2025年07月12日 来源:Stroke and Vascular Neurology

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  这篇研究通过整合孟德尔随机化(MR)、基于汇总数据的MR(SMR)和共定位分析,系统筛选了动脉瘤性蛛网膜下腔出血(aSAH)和未破裂颅内动脉瘤(uIA)的多组学治疗靶点。研究鉴定出PSMA4、PRCP等关键基因和蛋白,揭示其通过PI3K-Akt通路和细胞因子互作发挥作用,并通过分子 docking 验证了苯那普利与PRCP的稳定结合,为靶向治疗提供了新策略。

  

研究背景与意义

颅内动脉瘤(IA)是脑血管分支的局部病理性扩张,其中未破裂颅内动脉瘤(uIA)在人群中发生率约1-3%,而动脉瘤性蛛网膜下腔出血(aSAH)作为其最严重的并发症,占自发性蛛网膜下腔出血的主要部分,早期死亡率高达35%。遗传因素在IA的形成和破裂中扮演关键角色,但现有全基因组关联研究(GWAS)难以直接定位功能性基因。多组学数据(如eQTL、pQTL、mQTL)结合孟德尔随机化(MR)方法,为揭示分子机制提供了新思路。

研究方法与技术路线

研究采用三阶段验证框架:

  1. 发现阶段:从eQTLGen和GTEx V.8等数据库提取2629个基因的顺式eQTL和1073个血清蛋白的pQTL,通过MR分析其与IA、aSAH、uIA的因果关系。

  2. 垂直验证:利用芬兰基因组(FinnGen)和英国生物银行(UKB)数据验证初步靶点。

  3. 水平验证:通过SMR和共定位分析(PPH4>0.7为阈值)在多组学数据中交叉验证靶点可靠性。

此外,研究整合了甲基化QTL(mQTL)数据,探索表观遗传调控作用,并通过蛋白互作(PPI)网络、富集分析和单细胞测序解析靶点功能。

关键发现

靶点鉴定与验证

  • aSAH相关靶点:鉴定出9个基因(如促炎因子PSMA4、TNFSF12)和1个蛋白(IL1RL1),其中PSMA4通过蛋白酶体活性促进氧化应激,而PRCP(抗高血压相关羧肽酶)具有保护作用。

  • uIA相关靶点:RELT(TNF受体超家族成员)显著降低uIA风险,其甲基化位点cg06382664与基因表达呈负反馈调控。

  • 甲基化调控:PSMA4的cg04140906位点甲基化可抑制其促aSAH效应,而RELT的7个甲基化位点与uIA共定位,提示表观遗传修饰的关键作用。

机制与通路分析

富集分析显示,靶基因主要富集于PI3K-Akt和MAPK信号通路,而蛋白互作网络以细胞因子-受体相互作用为核心。单细胞数据表明,PRCP在内皮细胞高表达,PSMA4在CD4+/CD8+ T细胞和单核巨噬细胞中活跃,暗示免疫炎症机制参与IA进展。

药物开发潜力

分子对接显示:

  • 苯那普利与PRCP结合能低至-9.4 kcal/mol,提示其作为降压药的潜在重定位价值。

  • 蛋白酶体抑制剂卡非佐米(carfilzomib)与PSMA4强结合(-8.6 kcal/mol),但需警惕心血管毒性。

研究创新与局限

本研究首次整合多组学数据与MR/SMR/共定位三重验证,克服了既往研究仅依赖单一方法的局限性。然而,组织特异性表达差异、部分靶点药物结构缺失以及临床前模型验证不足仍需后续探索。

结论与展望

研究建立了从遗传变异到靶点治疗的转化路径,为aSAH和uIA的预防性治疗提供了PSMA4、PRCP等优先靶点。未来需通过跨组织多组学分析和实验验证,进一步推动靶向药物的临床转化。

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