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基于维生素B6代谢的弥漫性大B细胞淋巴瘤精准分子分型及预后风险模型构建
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月13日 来源:Discover Oncology 2.8
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本文针对弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的高度异质性导致治疗响应差异的临床难题,首次从维生素B6代谢视角展开系统研究。研究团队整合孟德尔随机化(MR)分析、加权基因共表达网络(WGCNA)和非负矩阵分解(NMF)技术,鉴定出PSAT1等关键基因的遗传保护作用,并基于48个代谢相关基因成功建立DLBCL四类新型分子亚型(Cluster 1-4)。进一步开发的五基因风险评分模型(LUM/TCIRG1/SIGLEC15/HNRNPH3/TSPYL5)在多个独立数据集(GSE10846/GSE31312/NCICCR-DLBCL)中验证可显著区分患者生存风险,结合临床指标构建的列线图(Nomogram)实现1/3/5年生存率精准预测。该研究为DLBCL个体化治疗提供全新代谢视角靶标。
弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)作为最常见的非霍奇金淋巴瘤,尽管R-CHOP方案显著改善了患者预后,仍有约30%患者面临治疗抵抗和复发。这种高度异质性与现有分子分型体系(如COO分型)的局限性密切相关。近年来研究发现,维生素B6代谢通过调节细胞周期、氧化应激和免疫微环境,在多种肿瘤中发挥关键作用。特别值得注意的是,DLBCL恶性转化的核心驱动因子MYC基因与维生素B6代谢存在双向调控:MYC可上调单碳代谢酶SHMT2(需维生素B6辅因子),而维生素B6又能抑制MYC蛋白表达。这种复杂互作网络提示维生素B6代谢可能是DLBCL精准分型的新突破口。
电子科技大学医学院附属四川省肿瘤医院(Sichuan Cancer Hospital & Institute, University of Electronic Science and Technology of China)联合郑州大学第一附属医院的研究团队在《Discover Oncology》发表创新性研究。该研究通过整合多组学分析技术,首次构建基于维生素B6代谢特征的DLBCL分子分型体系,并开发出具有临床转化价值的预后预测工具。
研究采用四步递进策略:
孟德尔随机化分析:基于IEU Open GWAS和eQTLGen数据库,以维生素B6代谢通路基因(PNPO/PDXK/PSAT1等)为暴露因素,淋巴瘤为结局,筛选工具变量(F>10,P<5×10-6);
多组学数据整合:利用TCGA-DLBC和GEO数据库(GSE10846/GSE117556等)的转录组与临床数据,通过WGCNA筛选MYC重排相关基因模块;
分子分型构建:基于48个维生素B6代谢核心基因,采用NMF算法对928例DLBCL样本分型;
预后模型建立:通过LASSO-Cox回归筛选标志物,在NCICCR-DLBCL等队列中进行外部验证。
MR分析发现PSAT1表达升高可降低淋巴瘤风险(IVW OR=0.83,P=0.037),为代谢干预提供遗传学证据(图2B)。在DLBCL队列中,MYC高表达组维生素B6代谢评分显著升高(P<0.001),揭示MYC重排与代谢重编程的关联(图S1)。
通过NMF聚类将DLBCL划分为四个亚型(图3A):
临床特征:Cluster 4预后最差(5年OS率<40%),Cluster 2预后最佳(HR=0.48,P<0.001),且与传统COO分型分布模式不同(图3E);
代谢差异:各亚型间维生素B6代谢评分存在显著梯度(Cluster 1>4>3>2,P<0.001),而ABC/GCB亚型间无差异(图3C-D);
微环境特征:Cluster 4呈现免疫抑制状态,表现为IFNG-IFNGR1/2信号异常激活(P<0.001)和CD8+T细胞耗竭,而Cluster 2具有更高免疫活性(图3I-J)。
基于Cluster 2/4的差异基因,构建包含LUM、TCIRG1、SIGLEC15、HNRNPH3和TSPYL5的风险模型:
RiskScore=?0.440×LUM?0.394×TCIRG1?0.221×SIGLEC15+0.585×HNRNPH3?0.451×TSPYL5该模型在训练集(5年AUC=0.859)、验证集及外部队列(GSE31312,HR=2.74,P<0.001)均显示优异预测性能(图4D-F)。值得注意的是:
高危组维生素B6代谢活性增强(P<0.001),且与碱化死亡(Alkaliptosis)呈负相关(图7A/D);
模型可补充现有分类体系,在DHITsig阳性(P=0.002)和MHG亚组(P<0.05)中仍具预测价值(图S2);
与IPI评分、MYC/BCL2重排等临床指标显著关联(图6A-F)。
整合风险评分与性别、COO分型等指标构建Nomogram(图8A),较传统IPI评分显著提升预测效能(1年DCA曲线下面积提高25%)。模型校准曲线显示预测/实际生存率高度一致(图8B)。
本研究首次揭示维生素B6代谢在DLBCL分子分型中的核心价值:
机制创新:证实PSAT1的遗传保护作用,阐明维生素B6代谢-MYC调控轴通过影响肿瘤微环境(如IFNG信号)驱动DLBCL异质性;
分型突破:建立的四类代谢亚型超越传统COO分型局限,尤其Cluster 4的高代谢-免疫抑制特征为靶向干预提供新方向;
临床价值:五基因风险模型实现跨平台(RNA-seq/microarray)、跨队列验证,结合Nomogram工具可直接指导个体化治疗决策。
该研究不仅为DLBCL精准医疗提供新型生物标志物,更开辟了"代谢-免疫"双轴调控的创新研究范式。未来可进一步探索维生素B6代谢抑制剂(如PDXK抑制剂)与免疫治疗的协同作用,推动难治性DLBCL治疗策略升级。
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