基于生物信息学方法探索SRC基因在泛癌中的潜在价值及其免疫调控机制

【字体: 时间:2025年07月13日 来源:Discover Oncology 2.8

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  本研究针对SRC基因在多种癌症中的表达差异及其与预后的关系展开深入探索。研究人员通过整合TCGA、TARGET和GTEx数据库,采用生物信息学方法系统分析了SRC在34种癌症中的表达特征,发现其在21种肿瘤中显著上调。研究揭示了SRC表达与总体生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)的显著相关性,特别是在LIHC(肝细胞癌)和PRAD(前列腺癌)中表现突出。通过TMB(肿瘤突变负荷)、MSI(微卫星不稳定性)和免疫浸润分析,证实SRC可能通过调节肿瘤微环境(TME)影响免疫治疗响应。该研究为SRC作为泛癌预后标志物和免疫治疗靶点提供了理论依据,发表于《Discover Oncology》。

  

癌症是全球公共卫生的重大威胁,其发生发展涉及复杂的基因调控网络。作为首个被发现的酪氨酸蛋白激酶(Tyrosine-Protein Kinase Src, SRC),其在细胞增殖、迁移和存活信号通路中的关键作用已被广泛认知,但SRC在泛癌中的系统性研究仍存在空白。尤其值得注意的是,SRC异常激活与多种癌症的恶性进展相关,但其作为免疫治疗靶点的潜力尚未明确。

为解决这一问题,来自国内研究机构(根据作者署名顺序推断为广西地区科研单位)的研究团队在《Discover Oncology》发表了突破性研究。该研究通过整合TCGA、TARGET和GTEx三大数据库的19,131例样本数据,采用多维度生物信息学分析方法,首次系统揭示了SRC在泛癌中的表达谱、预后价值及免疫调控机制。

研究主要采用以下关键技术:1)基于UCSC数据库的标准化泛癌数据集分析SRC差异表达;2)利用Cox比例风险模型和Kaplan-Meier曲线评估预后关联;3)通过Sangerbox平台分析TMB/MSI相关性;4)采用CIBERSORT、TIMER等算法解析免疫细胞浸润特征。

3.1 SRC在人类癌症中的表达谱
研究发现SRC在21种癌症(如GBM、LUAD、COAD等)中显著上调,而在PRAD、KIRC等10种肿瘤中下调(图1)。这种差异表达模式提示SRC可能具有组织特异性调控机制。

3.2 SRC表达的预后价值
生存分析显示,SRC高表达与BLCA、PRAD等癌症的不良预后显著相关,却在GBMLGG和LAML中呈现保护作用(图2)。这种"双刃剑"特性暗示SRC功能可能因癌症类型而异。

3.3 SRC与临床病理特征的关系
在STAD等肿瘤中,SRC表达呈现性别差异(男性更高);年龄相关性分析显示,SRC在CESC中随年龄增长而上调,在LIHC中则下降(图3)。这些发现为SRC的临床分层提供了依据。

3.4 SRC与TMB/MSI的关联
SRC表达与LUAD的TMB正相关,而与COAD的MSI负相关(图4)。这种特异性关联提示SRC可能通过基因组不稳定性途径影响免疫治疗响应。

3.5 SRC与免疫系统的相关性
研究发现SRC与VEGFA、CD276等免疫检查点基因显著共表达(图5)。免疫评分分析显示,SRC在多数癌症中与免疫/基质评分负相关(图6-7),但在UVM等肿瘤中呈现相反趋势。通过TIMER算法证实,SRC表达与PRAD中CD8+ T细胞浸润正相关,而与BLCA中的巨噬细胞呈负相关(图9)。

这项研究的重要意义在于:首次系统阐明了SRC在泛癌中的多维度特征,证实其不仅是预后标志物,更是免疫微环境的关键调控因子。特别值得注意的是,SRC与TMB/MSI的癌症特异性关联为精准免疫治疗提供了新思路。研究局限性在于缺乏体内外实验验证,未来需要更大样本和功能研究进一步确认SRC的免疫调控机制。这些发现为开发基于SRC的联合治疗策略奠定了理论基础,对推动肿瘤个体化治疗具有重要价值。

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