热带地区难治性癫痫的转录组特征:钙调蛋白激酶II亚型与选择性剪接的调控机制

【字体: 时间:2025年07月13日 来源:BMC Neurology 2.2

编辑推荐:

  本研究针对热带地区难治性癫痫(RE)的诊断难题,通过RNA-seq技术分析患者外周血转录组,鉴定出3,381个差异表达基因(DEGs)和1,471个差异剪接事件(DAS),发现CAMK2A/B/D与PDE4B、CYBB等基因的互作网络可能参与发病机制,为热带RE提供了新型生物标志物和治疗靶点。

  

癫痫作为一种慢性神经系统疾病,全球约7000万患者深受其扰,其中约30%会发展为药物难治性癫痫(RE)。在热带地区,特殊环境因素使癫痫发病率显著增高,但相关机制研究却严重匮乏。海南医学院第一附属医院的研究团队在《BMC Neurology》发表的最新研究,首次揭示了热带地区RE患者的独特分子特征。

研究人员采集海南地区5例RE患者和健康对照的外周血样本,采用Illumina Novaseq 6000平台进行150bp双端测序(PE150)。通过DESeq2和edgeR分析差异基因,结合rMATS检测选择性剪接事件,并利用qRT-PCR验证关键基因表达。

主要发现

  1. 差异表达基因特征:鉴定出2,266个上调和1,115个下调基因,其中钙调蛋白激酶II亚型CAMK2A/B显著上调,CAMK2D则异常下调。这些基因富集于嗅觉传导、神经营养信号等通路。

  2. 选择性剪接事件:发现1,471个差异剪接事件,53.5%为外显子跳跃(SE)。相关基因参与中性粒细胞脱颗粒等过程,与神经炎症密切相关。

  3. 关键互作网络:蛋白互作(PPI)分析显示CAMK2A与PDE4B、CYBB等8个剪接变体存在直接或间接相互作用,可能通过cAMP信号通路影响癫痫发作阈值。

这项研究首次系统描绘了热带RE的转录组图谱,提出CAMK2亚型表达失衡与选择性剪接协同作用的假说。特别值得注意的是,CAMK2A组成性激活可能降低癫痫发作阈值的发现,为理解热带RE的特殊性提供了新视角。研究鉴定的外周血生物标志物具有重要转化价值,为热带地区癫痫的精准诊断和非侵入性监测开辟了新途径。未来研究可进一步验证这些靶点在更大样本中的诊断效能,并探索基于剪接调控的新型治疗策略。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号