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热带地区难治性癫痫的转录组特征:钙调蛋白激酶II亚型与选择性剪接的调控机制
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月13日 来源:BMC Neurology 2.2
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本研究针对热带地区难治性癫痫(RE)的诊断难题,通过RNA-seq技术分析患者外周血转录组,鉴定出3,381个差异表达基因(DEGs)和1,471个差异剪接事件(DAS),发现CAMK2A/B/D与PDE4B、CYBB等基因的互作网络可能参与发病机制,为热带RE提供了新型生物标志物和治疗靶点。
癫痫作为一种慢性神经系统疾病,全球约7000万患者深受其扰,其中约30%会发展为药物难治性癫痫(RE)。在热带地区,特殊环境因素使癫痫发病率显著增高,但相关机制研究却严重匮乏。海南医学院第一附属医院的研究团队在《BMC Neurology》发表的最新研究,首次揭示了热带地区RE患者的独特分子特征。
研究人员采集海南地区5例RE患者和健康对照的外周血样本,采用Illumina Novaseq 6000平台进行150bp双端测序(PE150)。通过DESeq2和edgeR分析差异基因,结合rMATS检测选择性剪接事件,并利用qRT-PCR验证关键基因表达。
主要发现:
差异表达基因特征:鉴定出2,266个上调和1,115个下调基因,其中钙调蛋白激酶II亚型CAMK2A/B显著上调,CAMK2D则异常下调。这些基因富集于嗅觉传导、神经营养信号等通路。
选择性剪接事件:发现1,471个差异剪接事件,53.5%为外显子跳跃(SE)。相关基因参与中性粒细胞脱颗粒等过程,与神经炎症密切相关。
关键互作网络:蛋白互作(PPI)分析显示CAMK2A与PDE4B、CYBB等8个剪接变体存在直接或间接相互作用,可能通过cAMP信号通路影响癫痫发作阈值。
这项研究首次系统描绘了热带RE的转录组图谱,提出CAMK2亚型表达失衡与选择性剪接协同作用的假说。特别值得注意的是,CAMK2A组成性激活可能降低癫痫发作阈值的发现,为理解热带RE的特殊性提供了新视角。研究鉴定的外周血生物标志物具有重要转化价值,为热带地区癫痫的精准诊断和非侵入性监测开辟了新途径。未来研究可进一步验证这些靶点在更大样本中的诊断效能,并探索基于剪接调控的新型治疗策略。
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