mNGS技术确诊恙虫病肺炎一例：诊断挑战与技术创新

本研究报道了一例罕见恙虫病肺炎病例，通过支气管肺泡灌洗液(BALF)的宏基因组下一代测序(mNGS)技术成功检出恙虫病东方体(Orientia tsutsugamushi)，解决了传统检测方法难以诊断的临床难题。研究证实多西环素治疗有效，为恙虫病呼吸道感染的早期诊断提供了创新性解决方案，凸显mNGS在罕见病原体检测中的独特优势。

　　

在亚洲"恙虫病三角区"（包括中国、印度和东南亚），每年约有100万恙虫病新发病例，这种由恙螨叮咬传播的立克次体病可导致高达30%的死亡率。尽管典型症状包括发热、焦痂和淋巴结肿大，但约30%患者缺乏特征性皮损，而肺炎等呼吸道并发症更易被误诊为普通社区获得性肺炎(CAP)。延边大学附属医院的研究团队在《BMC Pulmonary Medicine》报道的这例特殊病例，揭示了现代分子诊断技术对罕见传染病诊治的革命性价值。

研究团队采用宏基因组下一代测序(mNGS)这一突破性技术，对58岁女性肺炎患者的支气管肺泡灌洗液进行检测。该技术通过自动化核酸提取、DNA/RNA双文库构建和高通量测序，仅用24小时便从2566条特异性序列中锁定恙虫病东方体，而传统培养方法全部阴性。这一发现使临床及时将治疗方案调整为多西环素（100mg bid），患者症状在9天内显著改善，6周后CT显示肺部病变完全吸收。

主要技术方法

研究采用MGI-200测序仪进行全基因组测序，通过Geneseeq试剂盒完成BALF样本的DNA/RNA同步提取和文库构建。质量控制后，使用Genseq-PM软件比对定制病原体数据库，检测下限达单个微生物基因组。同时进行常规细菌/真菌培养和血清学检测作为对照。

研究结果

临床表现：患者持续10天38°C发热伴咳嗽咳痰，CT显示右肺实变（图1A），初诊CAP但β-内酰胺类抗生素无效。值得注意的是，该病例发生在吉林非疫区且无典型焦痂，凸显地域分布变化带来的诊断挑战。

实验室特征：白细胞11.37×10⁹/L、中性粒细胞8.72×10⁹/L，C反应蛋白55.8mg/L，但降钙素原正常（0.1ng/mL），这种炎症指标分离现象提示非典型病原体感染。

影像学演变：治疗前CT显示右中叶支气管痰栓阻塞（图1A），对应病理改变为恙虫病特有的血管周围炎性浸润；治疗后6周病灶完全吸收（图1B），证实多西环素对胞内病原体的清除效果。

mNGS优势：相比传统IFA（间接免疫荧光法）需要专门设备，mNGS同时检出恙虫病东方体（2566条序列）、人疱疹病毒4型（24886条）和鼻病毒B（759条），通过序列数阈值和临床关联性准确判定主要病原体，展示其"一网打尽"的检测能力。

结论与意义

该研究首次证实mNGS对恙虫病肺炎的早期诊断价值：①突破血清学检测的"窗口期"限制，在抗体产生前实现病原体鉴定；②解决非疫区医生认知不足导致的漏诊问题；③为《中国恙虫病诊疗专家共识》添加了分子诊断依据。

研究同时警示：随着气候变暖，恙螨栖息地北扩可能导致更多非典型区域病例出现。而mNGS 55.8%的污染率（如检出上呼吸道定植病毒）提示需建立标准化阈值体系，这正是未来感染病精准诊断需要攻克的关键技术壁垒。