ASXL1基因突变谱在急性髓系白血病风险评估中的作用:来自巴基斯坦人群的遗传学证据

【字体: 时间:2025年07月13日 来源:BMC Genomic Data 1.9

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  本研究针对急性髓系白血病(AML)患者ASXL1基因突变谱开展深度分析,通过Illumina NextSeq500测序技术检测38例巴基斯坦AML患者样本,发现ASXL1外显子12-13区域存在8个罕见变异,其中p.G1336S错义突变与不良预后显著相关。研究证实ASXL1+(TP53/FLT3/NPM1阴性)患者总生存期显著缩短(p<0.05),为南亚人群AML精准诊疗提供了重要分子标志物。

  

急性髓系白血病(AML)作为成人最常见的急性白血病,近三十年来发病率上升15%,其治疗面临化疗耐药和高复发率的严峻挑战。尽管造血干细胞移植等治疗手段不断进步,约40%患者仍会出现复发。这种临床困境的背后,是AML高度的基因组异质性——就像一群戴着不同面具的敌人,需要精准的分子特征识别才能制定有效对策。

位于20号染色体的ASXL1基因,正是解码这些"分子面具"的关键靶点之一。这个编码1541个氨基酸的蛋白,通过ASXH和PHD结构域调控表观遗传修饰,其突变会导致C端截短,与AML-M5亚型和复杂核型密切相关。既往研究显示,ASXL1突变患者死亡率增加3.48倍,但相关研究多基于欧美人群,南亚人群数据严重缺失。

为填补这一空白,来自也门公共卫生与人口部(Ministry of Public Health and Population, Hadhramout, Yemen)的Salem Ahmed Bamusa团队联合巴基斯坦卡拉奇大学基因组研究中心,首次对巴基斯坦AML患者的ASXL1突变谱进行系统分析。研究人员采用Illumina NextSeq500测序平台,对38例患者进行靶向测序,通过严格的生物信息学流程(包括FastQC质控、BWA-MEM比对、GATK变异检测等)锁定致病突变,并与1000基因组计划及TCGA数据库进行跨人群比较。

主要技术方法包括:1)从外周血提取DNA进行Illumina文库制备;2)靶向富集ASXL1基因外显子区域;3)采用2×75bp双端测序策略;4)通过ANNOVAR等工具进行变异功能注释;5)利用Kaplan-Meier曲线分析患者生存数据。

ASXL1突变谱特征

研究发现每例患者平均携带1.13个ASXL1变异,显著高于健康人群(0.023-0.060变异/人)。在外显子12-13热点区域鉴定出8个罕见变异,包括两个患者共有的p.G1397S错义突变(NM_015338转录本)。Phyre2蛋白结构预测显示,该突变导致Asxl1蛋白"高尔夫球杆状"结构域变为"S型",溶剂可及表面积减少54.52?2,提示功能损害。

临床预后关联

排除TP53/FLT3等已知不良预后突变患者后,ASXL1+组中位生存期显著缩短(p<0.05)。与TCGA数据(n=126)趋势一致:ASXL1突变患者平均生存418.6天,较野生型患者(1074天)缩短2.56倍。

跨人群比较

巴基斯坦AML的ASXL1外显子变异频率(0.184/人)远超全球人群(0.037-0.061/人)。不同于TCGA报道的p.G738Dfs*6等突变,本研究发现的p.G1397S是南亚人群特有的潜在致病位点。

这项发表于《BMC Genomic Data》的研究具有三重意义:首先,证实ASXL1突变是独立于TP53等基因的预后标志物,为WHO 2022年AML分子分型提供了南亚人群证据;其次,发现p.G1397S等新型变异,为靶向药物开发提供新靶点;最后,建立适用于资源有限地区的ASXL1检测方案,推动精准医疗在发展中国家落地。正如研究者强调,扩大样本量并开展功能验证将是下一步重点,这或许能揭开ASXL1突变致AML的精确分子机制,为破解治疗耐药难题带来曙光。

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