
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
利用社区科学数据监测种群灭绝风险:一种高效本地持久性概率估计框架
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月14日 来源:Journal of Applied Ecology 4.8
编辑推荐:
本文创新性地提出并验证了一种基于社区科学数据(如eBird)的定量框架,通过连续状态空间模型(state-space models)迭代拟合数据,估计本地种群持久性概率(φ)。该方法结合风险监测框架(VPM),与标准化监测数据对比显示高度一致的灭绝风险趋势,即使在数据量减少至5%时仍保持稳健。这一工具为全球保护生物学提供了计算高效、易于应用的解决方案,尤其适用于缺乏标准化监测的区域。
监测种群灭绝风险是保护生物学和应用生态学的核心议题,但传统方法依赖成本高昂且覆盖有限的标准化监测数据。社区科学数据(如eBird)凭借其高时空分辨率,为弥补这一缺口提供了新机遇。然而,这类数据的异质性(如观察者偏好偏差)增加了分析复杂性。本文以濒危物种Everglades snail kite(食螺鸢)为模型系统,聚焦其新建立的佛罗里达州Payne's Prairie亚种群,旨在开发一种鲁棒框架,利用社区科学数据估计本地持久性概率(φ),并通过与标准化监测比较验证其准确性。
研究采用五阶段工作流:首先,从eBird下载2018–2024年食螺鸢数据,筛选完整清单(protocols为travelling或stationary),限制采样努力(≤5小时、≤5公里、≤10观察者),并分配到100-km2六边形空间网格。Payne's Prairie单元因数据重叠被选为重点区域,构建基于周最大计数的时序数据集。标准化监测数据来自长期航船调查和巢穴监测,覆盖同期。其次,应用风险监测框架(VPM),结合指数增长状态空间模型(EGSS)。该模型将未观测丰度Nt描述为Nt = N0exp(a + Et),其中Et ~ Normal(0, σ2)表示环境噪声,观测模型为Y(t) = X(t) + Fi(Fi ~ Normal(0, τ2)为观测噪声),参数包括lnλ(周对数丰度变化期望)、σ2(过程噪声方差)、τ2(观测噪声方差)和x0(初始对数丰度)。第三,通过VPM框架迭代估计持久性概率:在每周i,拟合EGSS模型,模拟50,000条轨迹,预测未来窗口(S250、S500、S1250周,对应5、10、25年),计算低于准灭绝阈值(Nc;eBird为5,标准化监测为32)的概率,其补集即为φ。第四,比较eBird与标准化监测的φ趋势,并执行敏感性分析:时间稀释(减少周数据)和采样稀释(减少清单数),评估数据量降至5%的影响。
EGSS模型预测的周最大计数与观测值高度吻合(标准化监测斜率=0.929±0.030,p<0.001)。参数估计显示,环境噪声方差σ2(eBird: 0.04, SM: 0.04)和初始丰度相似,但观测噪声方差τ<sup
生物通微信公众号
知名企业招聘