综述:阿尔茨海默病的蛋白质组学景观:新兴技术、进展与见解(2021-2025)

【字体: 时间:2025年07月15日 来源:Molecular Neurodegeneration 15.1

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  本文系统评述了2021-2025年阿尔茨海默病(AD)蛋白质组学研究的最新突破。通过质谱(MS)和亲和平台(如Olink、SomaScan)的技术革新,揭示了AD脑组织中866个共识蛋白的异常表达及淀粉样斑块微环境的关键组分(如MDK、SMOC1)。研究深入验证了这些蛋白在神经炎症、突触功能障碍中的作用机制,并挖掘了脑脊液(CSF)和血液中的新型生物标志物(如SPON1、GPNMB)。多组学整合(如pQTL分析)凸显了蛋白质周转失调在AD中的核心地位,为精准诊疗提供了分子基础。

  

综述内容归纳

技术创新驱动蛋白质组学深度解析

近年来,质谱技术的革新显著提升了阿尔茨海默病(AD)研究的精度与广度。基于串联质谱标签(TMT)的方法实现了多达35个样本的同步分析,覆盖超10,000个蛋白质,而数据非依赖采集(DIA)技术结合离子淌度分离(如Astral平台)可在微克级样本中检测近10,000个蛋白。亲和试剂平台(Olink、SomaScan)则通过抗体或适配体实现高通量靶向检测,弥补了质谱对低丰度蛋白的局限。单细胞与空间蛋白质组学技术(如质谱成像、多重免疫荧光)虽在AD中应用有限,但为解析细胞异质性和病理微环境(如淀粉样斑块周边)提供了新视角。


AD脑组织的共识蛋白特征

整合超30项蛋白质组学研究,AD脑组织中共鉴定出866个差异表达蛋白(DAPs),涵盖淀粉样基质、免疫激活和突触通路。其中,654个蛋白在小鼠模型(5xFAD、KI)中可检测,108个在模型中保守上调,40%源自小胶质细胞(如TREM2、GPNMB)。淀粉样蛋白组(amyloidome)分析揭示516个斑块富集蛋白,包括Aβ、APOE、HTRA1及新型调控因子SMOC1(延缓纤维形成)和NTN1(通过NF-κB/Nrf2通路抗神经毒性)。磷酸化蛋白质组学发现激酶信号(如MAPK、mTOR)紊乱,而tau蛋白存在95种翻译后修饰(PTMs),包括磷酸化、泛素化位点,影响其构象多样性。


关键蛋白的功能验证与机制突破

  • 淀粉样调控网络

    MDK与PTN通过结合Aβ调控纤维组装,但基因敲除小鼠中呈现剂量依赖性效应。SFRP1通过抑制ADAM10促进淀粉样前体蛋白(APP)加工,并激活小胶质细胞NF-κB通路加剧炎症。

  • 小胶质细胞介导的神经炎症

    GPNMB通过结合ATP6V1A促进Aβ吞噬;TREM2缺失加剧tau扩散;CTSS(半胱氨酸蛋白酶)破坏血脑屏障完整性;补体成分(如C1q)介导突触修剪。

  • 突触功能障碍

    NRN1稳定树突棘抵抗Aβ毒性,NPTX2通过结合C1q抑制过度突触消除,神经肽VGF过表达可挽救5xFAD小鼠记忆损伤。U1 snRNP组分(如U1-70K)的异常剪切导致广泛RNA代谢紊乱,直接关联认知衰退。

生物标志物:从脑脊液到血液

脑脊液(CSF)多队列研究确立SPON1、ITGB2、YWHAZ等为核心诊断标志物,其中SMOC1在症状出现前数十年即升高。AD患者CSF蛋白质组可划分为5种亚型,对应不同遗传背景与临床进展。血液检测中,Aβ42/Aβ40、p-tau217及新型标志物(如GFAP、NfL)已实现临床转化,而GPNMB、补体因子(如CO9)在血浆外泌体中显著富集。替代生物流体(唾液、泪液)中,CAP1、α-防御素等亦显示潜力。


多组学整合揭示调控网络

蛋白质数量性状位点(pQTL)分析将AD风险基因(如MS4A6A)与可溶性TREM2水平降低关联,跨组织(脑、CSF、血浆)pQTL图谱进一步锁定免疫与胶质细胞增殖通路。蛋白质-RNA表达差异(如MDK、NTN1在Aβ相关通路中RNA-蛋白解耦)提示转录后调控的重要性。5xFAD小鼠的蛋白质周转图谱证实,淀粉样微环境中的自噬/溶酶体组分周转延迟是导致差异的关键因素。

未来挑战与方向

单细胞与空间蛋白质组学需突破灵敏度瓶颈,以解析AD细胞类型特异性响应。生物标志物面板需整合PTMs和聚集体状态,以捕捉疾病异质性。网络蛋白质学结合动态信号追踪(如磷酸化流)将揭示核心致病模块,推动靶向干预策略。

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