珊瑚共生菌Roseobacter sp. EG26基因组解析：揭示宿主适应性进化与生物修复潜能

来自葡萄牙的研究团队通过对八放珊瑚Eunicella gazella共生菌Roseobacter sp. EG26的全基因组测序，揭示了该菌株通过II/III/IV/VI型分泌系统（T2SS/T3SS/T4SS/T6SS）、锚蛋白重复蛋白和牛磺酸降解通路适应宿主微环境的分子机制，并发掘其酚类化合物降解基因在海洋酸化背景下的生物修复潜力。

　　

在大西洋东北部海域的八放珊瑚Eunicella gazella组织中，科学家分离出一株具有特殊生态意义的玫瑰杆菌Roseobacter sp. EG26。通过Illumina MiSeq平台进行全基因组测序（覆盖度202.7x），组装获得5.09 Mb的高质量基因组（GC含量57.1%，完整度99.57%）。系统发育分析显示其与潮间带分离株Roseobacter insulae YSTF-M11仅77.07%平均核苷酸相似度，暗示为新物种。

该菌株基因组蕴藏着丰富的宿主适应相关元件：包括调控宿主互作的II/III/IV/VI型分泌系统（T2SS/T3SS/T4SS/T6SS）、参与信号转导的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，以及介导免疫逃逸的锚蛋白重复蛋白。特别值得注意的是，牛磺酸降解通路的发现揭示了其利用宿主代谢产物的能力。此外，甲烷/苯酚/甲苯羟化酶（PF02332.22）等酚类降解酶基因的检出，为应对海洋酸化导致的酚类物质积累提供了潜在的生物修复方案。

营养代谢方面，EG26具备完整的维生素B₁/B₆/B₇/B₉/B₁₂合成途径，可能对维持珊瑚共生体系稳态具有重要作用。该研究通过基因组注释技术（NCBI PGAP v6.10和Melange流程），为理解玫瑰杆菌科（Roseobacteraceae）在珊瑚健康与疾病中的双重角色提供了新的分子线索。