抗CMV TCR CDR3序列检测与胃腺癌及软组织肉瘤生存率关联的免疫基因组学研究

【字体: 时间:2025年07月15日 来源:APMIS 2.6

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  本研究通过全外显子测序(WXS)和RNA测序(RNAseq)技术,解析了胃腺癌(STAD)和软组织肉瘤(SARC)患者样本中的T细胞受体(TCR)CDR3序列特征。研究人员创新性地将检测到的互补决定区3(CDR3)氨基酸序列与已知抗巨细胞病毒(CMV)序列比对,发现从血液或肿瘤WXS数据中获得的抗CMV相关TRA/TRB重组读段与患者生存率正相关,而RNAseq数据中的对应序列却显示负相关。该发现为CMV感染与癌症预后的复杂关系提供了新见解,并为肿瘤免疫治疗靶点开发开辟了新思路。

  

在肿瘤免疫研究领域,一项突破性发现揭示了抗巨细胞病毒(CMV)T细胞受体(TCR)的特殊结构域——互补决定区3(CDR3)与癌症预后的微妙关联。科研人员从癌症基因组图谱(TCGA)中获取胃腺癌(STAD)和软组织肉瘤(SARC)样本的全外显子测序(WXS)和RNA测序(RNAseq)数据,通过生物信息学方法捕获TCR重组读段,并将其CDR3氨基酸(AA)序列与已知抗CMV序列进行精准匹配。

令人振奋的是,无论是血液还是肿瘤组织来源的WXS数据,只要检测到与抗CMV相匹配的TRA或TRB链CDR3序列,患者生存概率显著提升。然而戏剧性的是,RNAseq数据中对应的抗CMV TCR CDR3序列却与较差的预后相关。这一"双面刃"现象引发深度思考:癌症发生前的CMV暴露可能形成保护性免疫记忆,而癌症进展期间持续的CMV特异性T细胞反应反而可能加重机体负担?

该研究不仅为TCR CDR3作为新型预后标志物提供了实证依据,更暗示抗CMV免疫应答在肿瘤微环境中的双重作用。这些发现为开发基于CMV特异性TCR的精准免疫疗法奠定了理论基础,特别是对缺乏有效治疗手段的胃腺癌和软组织肉瘤患者具有重要临床意义。文末作者声明无利益冲突,确保研究结论的客观性。

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