非洲恶性疟原虫离体抗疟药效评估与基因型-表型关联研究（2016-2023年）

为解决非洲地区抗疟药物耐药性监测的迫切需求，研究人员对2016-2023年西非和中非地区805例恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）分离株开展离体药物敏感性（IC50）与基因型关联研究。通过分子倒置探针（MIPs）测序43个基因，发现pfcrt和pfmdr1突变频率逐年下降，且与多种药物敏感性显著相关。该研究为非洲抗疟策略优化提供了关键分子流行病学证据。

　　

疟疾仍是非洲公共卫生的重大威胁，而抗疟药物耐药性的出现正威胁着以青蒿素联合疗法（ACT）为核心的治疗策略。近年来，东非地区已报道青蒿素部分耐药（ART-R）和伴侣药物（如lumefantrine, LMF）敏感性降低的恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）虫株，但西非和中非地区的系统性耐药监测数据仍显不足。法国国家疟疾参考中心（French National Malaria Reference Centre, FNMRC）联合布朗大学等机构的研究人员，对2016-2023年法国输入的805例非洲恶性疟原虫分离株开展离体药物效价评估与全基因组靶向测序，相关成果发表于《eBioMedicine》。

研究团队采用标准离体生长抑制试验测定6种抗疟药（DHA、LMF、MFQ、CQ、MDAQ、PPQ）的半数抑制浓度（IC₅₀），并利用分子倒置探针（MIPs）对43个基因（含19个耐药基因）进行高通量测序。样本主要来自西非（59%）和中非（38%）旅行者，通过协变量校正和单倍型分析揭示关键基因突变与药物敏感性的关联。

地理来源与样本特征

805例分离株覆盖35个非洲国家，主要源自科特迪瓦（27%）和喀麦隆（21%）。62%感染者为男性，中位年龄39岁，中位原虫密度1.7%。

离体药物敏感性

所有药物IC₅₀中位数均低于30 nM，显示总体高效性。49%分离株对甲氟喹（MFQ）耐药（IC₅₀ >30 nM），10%对氯喹（CQ）耐药（IC₅₀ >100 nM）。西非与中非分离株仅对哌喹（PPQ）敏感性存在地域差异（p=0.0016）。

耐药基因突变谱

仅4例携带WHO确认的pfkelch13突变（Ala675Val等），均来自东非。pfcrt Lys76Thr（30%）和pfmdr1 Asn86Tyr（11%）突变频率逐年显著下降（p<0.01）。pfdhfr三重突变（IRN）占85.4%，但SP耐药五重突变仅3%。

基因型-表型关联

pfcrt突变与CQ/MDAQ耐药正相关（p=10^-43-10^-13），与ACT药物敏感性负相关。pfmdr1 Asn86Tyr使LMF/MFQ IC₅₀降低66.6%（p<10^-13）。新发现pfmdr1 Asp650Asn/Asn652Asp与LMF敏感性相关。单倍型分析显示pfcrt K76-pfmdr1 N86野生型对LMF敏感性最低。

讨论与意义

该研究首次系统揭示西非和中非恶性疟原虫对ACT药物仍保持高度敏感性，且多药耐药突变呈下降趋势，反映停用氯喹后虫群适应性进化。pfcrt/pfmdr1单倍型对药物敏感性的累加效应（如双突变使MDAQ IC₅₀升高155%）为组合用药策略提供依据。尽管pfkelch13耐药突变零星出现，但持续监测至关重要以防止东非耐药株扩散。研究建立的离体药敏-基因型关联模型，为非洲抗疟政策制定提供了精准分子标记。