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外泌体蛋白-代谢物-通路轴:癌症代谢重编程的生物信息学解析与诊断潜力
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月16日 来源:Journal of Proteins and Proteomics
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本研究通过整合ExoCarta数据库中的癌症特异性外泌体蛋白与代谢组学数据,采用CytoHubba筛选枢纽基因(如SLC5A6、SDHB等),结合GEPIA、UALCAN等多平台验证,揭示了外泌体蛋白通过调控脂代谢(PRKD1)、线粒体呼吸(SDHB)等通路驱动肿瘤代谢重编程,为癌症诊断提供新靶点。
外泌体(Exosomes)作为肿瘤微环境中的“分子快递员”,其携带的异常蛋白 cargo 正成为破解癌症代谢之谜的关键。研究者们从 ExoCarta 数据库中挖掘出 10 种癌症特有的外泌体蛋白,通过 CytoHubba 锁定 SLC5A6(膀胱癌)、SDHB(胰腺癌)等枢纽基因,并在 GEPIA、UALCAN 等数据库中验证其高表达。这些蛋白像代谢“开关”一样,激活了从二酰基甘油(DAG)代谢到泛醌(Ubiquinone)合成的通路网络——比如卵巢癌中 ATP6V0D1 驱动脂代谢,而 LYZ 基因则在肝癌中调控氨基糖通路。MetaboAnalyst 平台进一步发现,这些蛋白与磷酸盐代谢的异常密切相关,仿佛为肿瘤细胞装上了“能量加速器”。这项研究不仅用生物信息学绘制出蛋白-代谢物-通路的三维图谱,更提示外泌体蛋白可能成为癌症诊断的新型液态活检标志物。
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