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GALNT6通过O-连接糖基化调控口腔鳞癌发生发展的机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月16日 来源:Discover Oncology 2.8
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本研究针对口腔鳞状细胞癌(OSCC)预后差、缺乏有效治疗靶点的问题,通过生物信息学分析筛选出16个O-GlcNAc糖基化相关差异基因,结合机器学习算法鉴定出关键基因GALNT6。实验证实GALNT6在OSCC中异常高表达,其敲除可显著抑制癌细胞增殖、迁移并促进凋亡。该研究为OSCC提供了新的分子标志物和治疗靶点,发表于《Discover Oncology》。
口腔鳞状细胞癌(OSCC)占口腔恶性肿瘤的90%,全球年新增病例约30万例,但五年生存率长期低于40%。肿瘤转移、复发和耐药是临床治疗的主要瓶颈。近年研究发现,蛋白质O-连接N-乙酰葡糖胺修饰(O-GlcNAcylation)异常与多种癌症进展密切相关,但在OSCC中的作用机制尚不明确。
南昌大学第一附属医院口腔颌面外科的研究团队通过整合GSE23558和GSE25099两个基因表达数据集,筛选出1309个差异表达基因(DEGs),其中16个与O-GlcNAcylation相关。采用LASSO回归、随机森林(RF)和支持向量机(SVM)三种机器学习算法,最终锁定MUC15、ADAMTS12、GALNT6和FUT6四个关键基因。实验验证发现GALNT6在OSCC细胞系(CAL27、SSC-25、HSC-3)和临床样本中显著高表达。通过siRNA敲除技术证实,抑制GALNT6可降低细胞活力(CCK8检测)、减少克隆形成(下降约60%)、抑制划痕愈合率(降低45%)和Transwell侵袭能力,同时促进细胞凋亡(流式检测增加2.3倍)。该研究发表于《Discover Oncology》,首次揭示GALNT6通过调控O-GlcNAcylation促进OSCC发展的分子机制。
关键技术包括:1) GEO数据库获取57例OSCC和27例正常组织的转录组数据;2) 机器学习算法筛选特征基因;3) qRT-PCR和Western blot验证基因表达;4) siRNA转染构建基因敲除模型;5) CCK8、克隆形成、划痕实验和Transwell多维度评估细胞表型。
主要研究结果:
差异基因分析:发现657个上调和652个下调基因,显著富集于PI3K-Akt信号通路和细胞外基质受体相互作用。
关键基因筛选:GALNT6的AUC值达0.996,在OSCC细胞中mRNA表达量较正常细胞(WSU-HN30)升高3.8倍。
功能实验:si-GALNT6-#3转染效率最高(抑制率达75%),使细胞迁移面积减少52%,侵袭细胞数下降68%。
结论指出,GALNT6作为O-糖基化转移酶家族成员,通过异常糖基化修饰驱动OSCC恶性进展。该研究不仅为OSCC早期诊断提供新型分子标志物,更揭示了靶向糖基化通路治疗OSCC的潜在价值。值得注意的是,临床样本分析显示9/10的肿瘤组织存在GALNT6过表达,这种特征性改变可能成为未来液体活检的重要靶点。讨论部分强调,GALNT6可能通过影响DNA复制和细胞周期相关通路(GSEA分析显示NES=2.11)发挥作用,这为后续机制研究指明了方向。
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