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全稻谷类黄酮与多酚含量的多环境全基因组关联分析揭示关键基因组区域
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年07月16日 来源:Journal of Agriculture and Food Research 4.8
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考古学家如何突破移民研究的二元对立框架?本期专题通过7个案例研究,探讨了移民考古学中长期存在的"非此即彼"思维困境。研究者提出应解构民族区域类别的固定认知,同时关注空间文化关联的政治影响,为动态理解移民群体的物质文化适应策略提供了新视角。
在功能性食品研究领域,稻米中的类黄酮(flavonoid)和多酚(polyphenol)作为重要的次生代谢产物,其含量差异直接影响作物的营养价值和健康功效。然而这些性状受多基因调控且存在显著的环境互作效应(G×E),传统定位方法难以全面揭示其遗传基础。针对这一难题,研究人员在《Journal of Agriculture and Food Research》发表论文,通过多环境全基因组关联分析(GWAS)系统解析了全稻谷中这些活性成分的遗传调控网络。
研究采用全基因组重测序技术对涵盖不同生态区的核心种质资源进行基因型分析,结合高效液相色谱(HPLC)定量检测样本的类黄酮和多酚含量。通过建立混合线性模型(MLM)校正群体结构影响,在3种差异环境中开展跨季节表型鉴定。
关键结果
多环境GWAS共检测到27个显著关联位点,其中8个在至少两种环境中稳定出现
染色体7上发现1个主效QTL(qFL7.2)可解释12.3%的类黄酮含量变异
候选基因OsF3H(黄烷酮3-羟化酶)的启动子区存在关键SNP变异
环境互作分析揭示海拔高度与3个位点存在显著互作效应(p<0.001)
该研究首次在全基因组尺度上阐明了稻米功能性成分的多基因调控体系,发现的稳定位点可作为分子标记用于优质品种选育。环境特异性位点的鉴定为开展区域性精准育种提供了理论依据,而候选基因的挖掘则为代谢通路调控研究开辟了新方向。研究建立的"基因型-环境-表型"三维分析框架,为复杂性状的遗传解析提供了方法论参考。
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