高灵敏度自动化检测新标杆:cobas SARS-CoV-2 & Influenza A/B v2 在鼻咽拭子中的性能验证

【字体: 时间:2025年07月16日 来源:Microbiology Spectrum 3.7

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  【编辑推荐】本研究评估了cobas SARS-CoV-2 & Influenza A/B v2检测试剂(基于cobas 5800系统)与Allplex检测的对比性能,证实其对SARS-CoV-2、流感A/B的检测灵敏度(LoD低至11.0-25.3 copies/mL)和特异性(无29种非靶病原体交叉反应)表现优异,PPA达100%,NPA>98.3%,为呼吸道病毒共流行期的高通量自动化检测提供解决方案。

  

ABSTRACT

cobas SARS-CoV-2 & Influenza A/B v2检测试剂作为新型高通量自动化分子检测方案,在Roche cobas 5800系统上展现出卓越性能。研究通过871例鼻咽拭子标本(含164例SARS-CoV-2阳性、76例流感A阳性、77例流感B阳性及554例阴性)的平行测试显示:与Allplex检测相比,其阳性符合率(PPA)达100%,阴性符合率(NPA)为98.3%-99.3%,Cohen’s kappa值0.95-0.96。检测限(LoD)显著优于同类产品(SARS-CoV-2 E/ORF1ab基因分别为25.3/12.4 copies/mL,流感A/B为16.1/11.0 copies/mL),且无29种呼吸道病原体交叉反应。

INTRODUCTION

呼吸道病毒混合感染诊断面临重大挑战。SARS-CoV-2与流感病毒症状重叠,而现有分子检测存在通量低、耗时长等问题。cobas v2检测通过双靶点设计(SARS-CoV-2靶向E/ORF1ab基因,流感A靶向M1/M2/PB2基因,流感B靶向NEP/NS1基因),配合cobas 5800/6800/8800系统实现全流程自动化,较v1版本灵敏度提升。

MATERIALS AND METHODS

研究纳入2016-2024年存档标本,采用PowerChek和BIOFIRE Respiratory 2.1plus Panel作为参照。通过probit回归计算LoD,使用AMPLIRUN标准品验证灵敏度(20次重复测试),29种病原体评估特异性。统计学分析包括PPA/NPA计算、Cohen’s kappa和Pearson相关性检验。

RESULTS

• 分析性能:流感B检测灵敏度最高(11.0 copies/mL),所有靶标在100 copies/mL浓度下均100%检出

• 临床一致性:12例SARS-CoV-2、7例流感A、6例流感B标本存在检测差异,高Ct值(34.1-36.9)提示低病毒载量

• 交叉验证:PowerChek复测显示6/7流感A、3/6流感B差异标本为真阳性,印证cobas超高灵敏度优势

DISCUSSION

该检测系统三大核心价值凸显:

  1. 灵敏度突破:可识别Ct>35的低载量样本,较Allplex(LoD 248.9-1,649.6 copies/mL)提升10-100倍

  2. 流程革新:单系统8小时处理1,344例标本,较BIOFIRE(45分钟/1例)、Xpert(30分钟/4例)大幅提升通量

  3. 临床时效性:在2024年韩国冬春季SARS-CoV-2/流感共流行期间,平均报告时间缩短至4.2小时

局限性与展望:存档标本可能影响RNA稳定性,未来需多中心验证;虽未覆盖呼吸道合胞病毒(RSV),但新推出的cobas Respiratory flex检测已实现12种呼吸道病原体联检。

ACKNOWLEDGMENTS

研究获韩国 Roche Diagnostics 及保健产业振兴院(KHIDI)资助(RS-2024-00332244),印证产学研合作对提升公共卫生应急检测能力的关键作用。

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