应用宏基因组下一代测序技术(mNGS)提升窦道型人工关节感染诊疗水平的回顾性研究

这篇回顾性研究创新性地评估了宏基因组下一代测序(mNGS)在窦道型人工关节感染(PJI)中的临床应用价值。研究显示mNGS较传统培养显著提高病原体检出率(88.9% vs 50.0%)，尤其擅长检测混合感染(38.9% vs 5.6%)。采用mNGS指导治疗的窦道PJI患者2年治愈率达94.4%，且抗生素使用时间缩短11.49天，为复杂PJI的精准诊疗提供了新范式。

　　

Abstract

研究背景揭示人工关节感染(PJI)合并窦道形成的诊断困境：传统培养方法受限于生物膜形成、抗生素预处理等因素，对混合感染检出率不足50%。窦道作为病原体蓄积和扩散的特殊解剖结构，显著增加微生物群落复杂性。

Materials and Methods

福建医科大学附属第一医院回顾性纳入2019-2024年52例PJI患者，分为mNGS组(43例，含18例窦道PJI)和非mNGS对照组(9例窦道PJI)。采用多学科协作模式解读mNGS结果，通过BGISEQ-2000平台进行500bp单端测序。治疗成功标准严格遵循2013国际共识。

Results

数据呈现三大突破性发现：

1. 检测效能方面，mNGS在窦道PJI中检出16例病原体(88.9%)，显著高于培养的9例(50.0%)(RR 1.78)；

2. 混合感染识别率mNGS达38.9%(7/18)，较培养的5.6%(1/18)提升7倍；

3. 临床结局显示mNGS组2年治愈率提升38.9%，抗生素疗程缩短至35.62±5.42天(P<0.01)。

Discussion

研究创新点在于首次系统评估mNGS对窦道PJI的治疗指导价值：

• 揭示窦道微环境的特殊微生物生态，检测到45种细菌物种；

• 建立"病原体-抗生素"精准匹配模型，使万古霉素使用量减少23%；

• 提出"阈值判定+临床关联"的mNGS结果解读框架。

Conclusions

该研究证实mNGS可突破传统诊断瓶颈，其"三高一快"特点(高检出率、高混合感染识别率、高治愈率、快治疗周期)尤其适用于窦道PJI。建议将mNGS列为复杂PJI的一线诊断工具，但需注意区分定植菌与致病菌的临床相关性。

全文通过详实数据证明，mNGS指导的精准治疗使窦道PJI患者避免二次手术的风险降低62%，为《MSIS指南》的更新提供了Level III级证据。未来需开展多中心研究验证不同测序平台的一致性，并探索耐药基因检测的临床应用价值。